Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23325 Date Thu Jan 5 11:39:22 GMT 2012 Unique Job ID 8e718d968eab9992

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	T	R	I	P	R	S	S	F	S	A	N	I	N	N	T	A	Q	T	N	E	H	Q	T	L	S	E	L	F	Y	K	E	L	E	D	K	F	S	G	K	E	L	A	T	P	L	L	K	S	F	S	E	N	C	R	Q	N	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	I	F	S	N	K	D	F	V	I	K	F	S	T	S	V	L	Q	A	D	K	K	E	I	T	I	I	N	K	N	E	N	T	T	L	T	Q	T	I	A	P	I	F	E	K	Y	L	M	E	I	L	P	Q	R	S	D	T	L	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	E	L	N	L	K	S	D	R	K	E	K	E	F	P	R	I	K	L	N	G	Q	C	Y	F	P	G	R	P	Q	N	R	I	V	C	R	H	I	A	A	Q	Y	I	N	D	I	Y	Q	N	V	D	Y	K	P	H	Q	D	D	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	A	E	K	F	L	T	H	F	N	K	K	C	K	N	Q	T	L	A	L	V	S	S	R	P	E	G	R	C	V	A	A	C	G	D	F	G	L	V	M	K	A	Y	F	D	K	M	E	S	N	G	I	S	V	M	A	A	I	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?		?					?							?	?		?	?	?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	D	N	H	A	L	T	V	R	L	R	I	K	N	T	T	E	G	C	T	H	Y	V	V	S	V	Y	D	P	N	V	T	N	D	K	I	R	I	M	S	E	S	K	E	N	I	K	H	Y	S	L	M	D	F	M	N	V	D	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	K	W	S	N	D	H	V	I	N	Q	S	V	A	I	I	P	A	L	P	K	E	Q	L	L	M	L	K	G	S	V	D	E	I	T	P	P	L	S	P	A	T	M	N	L	L	M	A	I	G	Q	N	H	Q	L	T	Q	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	Q	L	Q	K	M	P	E	L	H	R	T	E	M	L	T	A	Y	N	S	I	N	L	P	G	L	Y	L	A	I	N	Y	G	N	A	D	I	V	E	T	I	F	N	S	L	S	E	T	G	Y	E	G	L	L	S	K	K	N	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	I	L	E	A	K	D	K	N	G	F	S	G	L	F	L	A	I	S	R	K	D	K	N	V	V	T	S	I	L	N	A	L	P	K	L	A	A	T	H	H	L	D	N	E	Q	V	Y	K	F	L	S	A	K	N	R	T	S	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	L	Y	H	V	M	A	N	G	D	A	D	M	L	K	I	V	L	N	A	L	P	L	L	I	R	T	C	H	L	T	K	E	Q	V	L	D	L	L	K	A	K	D	F	Y	G	C	P	G	L	Y	L	A	M	Q	N	G	H	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	V	K	V	I	L	E	A	L	P	S	L	A	Q	E	I	N	I	S	A	S	D	I	V	D	L	L	T	A	K	S	L	A	R	D	T	G	L	F	M	A	M	Q	R	G	H	M	N	V	I	N	T	I	F	N	A	L	P	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		F	N	T	F	K	F	D	K	K	N	M	K	P	L	L	L	A	N	N	S	N	E	Y	P	G	L	F	S	A	I	Q	H	K	Q	Q	N	V	V	E	T	V	Y	L	A	L	S	D	H	A	R	L	F	G	F	T	A	E	D	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		D	F	W	Q	H	K	A	P	Q	K	Y	S	A	F	E	L	A	F	E	F	G	H	R	V	I	A	E	L	I	L	N	T	L	N	K	M	A	E	S	F	G	F	T	D	N	P	R	Y	I	A	E	K	N	Y	M	E	A	L	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																												?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	A	S	P	H	T	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand