Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P02942 Date Thu Jan 5 10:57:47 GMT 2012 Unique Job ID 8e298af193d1f7ee

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	R	I	K	I	V	T	S	L	L	L	V	L	A	V	F	G	L	L	Q	L	T	S	G	G	L	F	F	N	A	L	K	N	D	K	E	N	F	T	V	L	Q	T	I	R	Q	Q	Q	S	T	L	N	G	S	W	V	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	Q	T	R	N	T	L	N	R	A	G	I	R	Y	M	M	D	Q	N	N	I	G	S	G	S	T	V	A	E	L	M	E	S	A	S	I	S	L	K	Q	A	E	K	N	W	A	D	Y	E	A	L	P	R	D	P	R	Q	S	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	A	A	E	I	K	R	N	Y	D	I	Y	H	N	A	L	A	E	L	I	Q	L	L	G	A	G	K	I	N	E	F	F	D	Q	P	T	Q	G	Y	Q	D	G	F	E	K	Q	Y	V	A	Y	M	E	Q	N	D	R	L	H	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	V	S	D	N	N	A	S	Y	S	Q	A	M	W	I	L	V	G	V	M	I	V	V	L	A	V	I	F	A	V	W	F	G	I	K	A	S	L	V	A	P	M	N	R	L	I	D	S	I	R	H	I	A	G	G	D	L	V	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	E	V	D	G	S	N	E	M	G	Q	L	A	E	S	L	R	H	M	Q	G	E	L	M	R	T	V	G	D	V	R	N	G	A	N	A	I	Y	S	G	A	S	E	I	A	T	G	N	N	D	L	S	S	R	T	E	Q	Q	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	E	E	T	A	A	S	M	E	Q	L	T	A	T	V	K	Q	N	A	E	N	A	R	Q	A	S	H	L	A	L	S	A	S	E	T	A	Q	R	G	G	K	V	V	D	N	V	V	Q	T	M	R	D	I	S	T	S	S	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	A	D	I	I	S	V	I	D	G	I	A	F	Q	T	N	I	L	A	L	N	A	A	V	E	A	A	R	A	G	E	Q	G	R	G	F	A	V	V	A	G	E	V	R	N	L	A	Q	R	S	A	Q	A	A	R	E	I	K	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	E	D	S	V	G	K	V	D	V	G	S	T	L	V	E	S	A	G	E	T	M	A	E	I	V	S	A	V	T	R	V	T	D	I	M	G	E	I	A	S	A	S	D	E	Q	S	R	G	I	D	Q	V	G	L	A	V	A	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	R	V	T	Q	Q	N	A	A	L	V	E	E	S	A	A	A	A	A	A	L	E	E	Q	A	S	R	L	T	E	A	V	A	V	F	R	I	Q	Q	Q	Q	R	E	T	S	A	V	V	K	T	V	T	P	A	A	P	R	K	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Sequence		V	A	D	S	E	E	N	W	E	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand