Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07363 Date Thu Jan 5 11:00:16 GMT 2012 Unique Job ID 8dd1e07e1a175ea2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	M	D	I	S	D	F	Y	Q	T	F	F	D	E	A	D	E	L	L	A	D	M	E	Q	H	L	L	V	L	Q	P	E	A	P	D	A	E	Q	L	N	A	I	F	R	A	A	H	S	I	K	G	G	A	G	T	F	G	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																												?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	L	Q	E	T	T	H	L	M	E	N	L	L	D	E	A	R	R	G	E	M	Q	L	N	T	D	I	I	N	L	F	L	E	T	K	D	I	M	Q	E	Q	L	D	A	Y	K	Q	S	Q	E	P	D	A	A	S	F	D	Y	I	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?			?	?	?	?																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	A	L	R	Q	L	A	L	E	A	K	G	E	T	P	S	A	V	T	R	L	S	V	V	A	K	S	E	P	Q	D	E	Q	S	R	S	Q	S	P	R	R	I	I	L	S	R	L	K	A	G	E	V	D	L	L	E	E	E	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		H	L	T	T	L	T	D	V	V	K	G	A	D	S	L	S	A	I	L	P	G	D	I	A	E	D	D	I	T	A	V	L	C	F	V	I	E	A	D	Q	I	T	F	E	T	V	E	V	S	P	K	I	S	T	P	P	V	L	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	A	E	Q	A	P	T	G	R	V	E	R	E	K	T	T	R	S	N	E	S	T	S	I	R	V	A	V	E	K	V	D	Q	L	I	N	L	V	G	E	L	V	I	T	Q	S	M	L	A	Q	R	S	S	E	L	D	P	V	N	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?																														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	D	L	I	T	S	M	G	Q	L	Q	R	N	A	R	D	L	Q	E	S	V	M	S	I	R	M	M	P	M	E	Y	V	F	S	R	Y	P	R	L	V	R	D	L	A	G	K	L	G	K	Q	V	E	L	T	L	V	G	S	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	L	D	K	S	L	I	E	R	I	I	D	P	L	T	H	L	V	R	N	S	L	D	H	G	I	E	L	P	E	K	R	L	A	A	G	K	N	S	V	G	N	L	I	L	S	A	E	H	Q	G	G	N	I	C	I	E	V	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	G	A	G	L	N	R	E	R	I	L	A	K	A	A	S	Q	G	L	T	V	S	E	N	M	S	D	D	E	V	A	M	L	I	F	A	P	G	F	S	T	A	E	Q	V	T	D	V	S	G	R	G	V	G	M	D	V	V	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	I	Q	K	M	G	G	H	V	E	I	Q	S	K	Q	G	T	G	T	T	I	R	I	L	L	P	L	T	L	A	I	L	D	G	M	S	V	R	V	A	D	E	V	F	I	L	P	L	N	A	V	M	E	S	L	Q	P	R	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		D	L	H	P	L	A	G	G	E	R	V	L	E	V	R	G	E	Y	L	P	I	V	E	L	W	K	V	F	N	V	A	G	A	K	T	E	A	T	Q	G	I	V	V	I	L	Q	S	G	G	R	R	Y	A	L	L	V	D	Q	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
Sequence		G	Q	H	Q	V	V	V	K	N	L	E	S	N	Y	R	K	V	P	G	I	S	A	A	T	I	L	G	D	G	S	V	A	L	I	V	D	V	S	A	L	Q	A	I	N	R	E	Q	R	M	A	N	T	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?	?																															?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand