Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39358 Date Thu Jan 5 11:59:48 GMT 2012 Unique Job ID 8d313280ba75998e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	V	R	N	I	F	A	D	E	S	H	D	I	Y	T	V	R	T	H	A	D	G	P	D	G	E	L	P	L	T	A	E	M	L	I	N	R	P	S	G	D	L	F	G	M	T	M	N	A	G	M	G	W	S	P	D	E	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?					?				?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?							?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	D	G	I	L	L	L	S	T	L	G	G	L	R	G	A	D	G	K	P	V	A	L	A	L	H	Q	G	H	Y	E	L	D	I	Q	M	K	A	A	A	E	V	I	K	A	N	H	A	L	P	Y	A	V	Y	V	S	D	P	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	R	T	Q	G	T	T	G	M	F	D	S	L	P	Y	R	N	D	A	S	M	V	M	R	R	L	I	R	S	L	P	D	A	K	A	V	I	G	V	A	S	C	D	K	G	L	P	A	T	M	M	A	L	A	A	Q	H	N	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	V	L	V	P	G	G	A	T	L	P	A	K	D	G	E	D	N	G	K	V	Q	T	I	G	A	R	F	A	N	G	E	L	S	L	Q	D	A	R	R	A	G	C	K	A	C	A	S	S	G	G	G	C	Q	F	L	G	T	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?													?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	S	Q	V	V	A	E	G	L	G	L	A	I	P	H	S	A	L	A	P	S	G	E	P	V	W	R	E	I	A	R	A	S	A	R	A	A	L	N	L	S	Q	K	G	I	T	T	R	E	I	L	T	D	K	A	I	E	N	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	H	A	A	F	G	G	S	T	N	L	L	L	H	I	P	A	I	A	H	Q	A	G	C	H	I	P	T	V	D	D	W	I	R	I	N	K	R	V	P	R	L	V	S	V	L	P	N	G	P	V	Y	H	P	T	V	N	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	A	G	G	V	P	E	V	M	L	H	L	R	S	L	G	L	L	H	E	D	V	M	T	V	T	G	S	T	L	K	E	N	L	D	W	W	E	H	S	E	R	R	Q	R	F	K	Q	L	L	L	D	Q	E	Q	I	N	A	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?					?	?		?		?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	I	M	S	P	Q	Q	A	K	A	R	G	L	T	S	T	I	T	F	P	V	G	N	I	A	P	E	G	S	V	I	K	S	T	A	I	D	P	S	M	I	D	E	Q	G	I	Y	Y	H	K	G	V	A	K	V	Y	L	S	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?		?																						?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	A	I	Y	D	I	K	H	D	K	I	K	A	G	D	I	L	V	I	I	G	V	G	P	S	G	T	G	M	E	E	T	Y	Q	V	T	S	A	L	K	H	L	S	Y	G	K	H	V	S	L	I	T	D	A	R	F	S	G	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?	?																						?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	G	A	C	I	G	H	V	G	P	E	A	L	A	G	G	P	I	G	K	L	R	T	G	D	L	I	E	I	K	I	D	C	R	E	L	H	G	E	V	N	F	L	G	T	R	S	D	E	Q	L	P	S	Q	E	E	A	T	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Sequence		L	N	A	R	P	S	H	Q	D	L	L	P	D	P	E	L	P	D	D	T	R	L	W	A	M	L	Q	A	V	S	G	G	T	W	T	G	C	I	Y	D	V	N	K	I	G	A	A	L	R	D	F	M	N	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?																							?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand