Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P19642 Date Thu Jan 5 11:37:27 GMT 2012 Unique Job ID 8c024cd681570eaf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	A	K	T	A	P	K	V	T	L	W	E	F	F	Q	Q	L	G	K	T	F	M	L	P	V	A	L	L	S	F	C	G	I	M	L	G	I	G	S	S	L	S	S	H	D	V	I	T	L	I	P	V	L	G	N	P	V	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																?	?		?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	I	F	T	W	M	S	K	I	G	S	F	A	F	S	F	L	P	V	M	F	C	I	A	I	P	L	G	L	A	R	E	N	K	G	V	A	A	F	A	G	F	I	G	Y	A	V	M	N	L	A	V	N	F	W	L	T	N	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	L	P	T	T	D	A	A	V	L	K	A	N	N	I	Q	S	I	L	G	I	Q	S	I	D	T	G	I	L	G	A	V	I	A	G	I	I	V	W	M	L	H	E	R	F	H	N	I	R	L	P	D	A	L	A	F	F	G	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	F	V	P	I	I	S	S	L	V	M	G	L	V	G	L	V	I	P	L	V	W	P	I	F	A	M	G	I	S	G	L	G	H	M	I	N	S	A	G	D	F	G	P	M	L	F	G	T	G	E	R	L	L	L	P	F	G	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	I	L	V	A	L	I	R	F	T	D	A	G	G	T	Q	E	V	C	G	Q	T	V	S	G	A	L	T	I	F	Q	A	Q	L	S	C	P	T	T	H	G	F	S	E	S	A	T	R	F	L	S	Q	G	K	M	P	A	F	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	L	P	G	A	A	L	A	M	Y	H	C	A	R	P	E	N	R	H	K	I	K	G	L	L	I	S	G	L	I	A	C	V	V	G	G	T	T	E	P	L	E	F	L	F	L	F	V	A	P	V	L	Y	V	I	H	A	L	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	L	G	F	T	V	M	S	V	L	G	V	T	I	G	N	T	D	G	N	I	I	D	F	V	V	F	G	I	L	H	G	L	S	T	K	W	Y	M	V	P	V	V	A	A	I	W	F	V	V	Y	Y	V	I	F	R	F	A	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	F	N	L	K	T	P	G	R	D	S	E	V	A	S	S	I	E	K	A	V	A	G	A	P	G	K	S	G	Y	N	V	P	A	I	L	E	A	L	G	G	A	D	N	I	V	S	L	D	N	C	I	T	R	L	R	L	S	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Sequence		D	M	S	L	V	N	V	Q	A	L	K	D	N	R	A	I	G	V	V	Q	L	N	Q	H	N	L	Q	V	V	I	G	P	Q	V	Q	S	V	K	D	E	M	A	G	L	M	H	T	V	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand