Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36837 Date Thu Jan 5 11:53:54 GMT 2012 Unique Job ID 8bc4e76f7e25e2f3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	T	T	T	P	M	G	M	L	Q	Q	P	R	P	F	F	M	I	F	F	V	E	L	W	E	R	F	G	Y	Y	G	V	Q	G	V	L	A	V	F	F	V	K	Q	L	G	F	S	Q	E	Q	A	F	V	T	F	G	A	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	V	Y	G	L	I	S	I	G	G	Y	V	G	D	H	L	L	G	T	K	R	T	I	V	L	G	A	L	V	L	A	I	G	Y	F	M	T	G	M	S	L	L	K	P	D	L	I	F	I	A	L	G	T	I	A	V	G	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	F	K	A	N	P	A	S	L	L	S	K	C	Y	P	P	K	D	P	R	L	D	G	A	F	T	L	F	Y	M	S	I	N	I	G	S	L	I	A	L	S	L	A	P	V	I	A	D	R	F	G	Y	S	V	T	Y	N	L	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	G	L	I	I	A	L	L	V	Y	I	A	C	R	G	M	V	K	D	I	G	S	E	P	D	F	R	P	M	S	F	S	K	L	L	Y	V	L	L	G	S	V	V	M	I	F	V	C	A	W	L	M	H	N	V	E	V	A	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?			?	?			?	?	?	?	?		?	?																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	L	I	V	L	S	I	V	V	T	I	I	F	F	R	Q	A	F	K	L	D	K	T	G	R	N	K	M	F	V	A	F	V	L	M	L	E	A	V	V	F	Y	I	L	Y	A	Q	M	P	T	S	L	N	F	F	A	I	N	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?		?	?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		H	H	E	I	L	G	F	S	I	N	P	V	S	F	Q	A	L	N	P	F	W	V	V	L	A	S	P	I	L	A	G	I	Y	T	H	L	G	N	K	G	K	D	L	S	M	P	M	K	F	T	L	G	M	F	M	C	S	L	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	T	A	A	A	A	G	M	W	F	A	D	A	Q	G	L	T	S	P	W	F	I	V	L	V	Y	L	F	Q	S	L	G	E	L	F	I	S	A	L	G	L	A	M	I	A	A	L	V	P	Q	H	L	M	G	F	I	L	G	M	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	L	T	Q	A	A	A	F	L	L	G	G	Y	V	A	T	F	T	A	V	P	D	N	I	T	D	P	L	E	T	L	P	V	Y	T	N	V	F	G	K	I	G	L	V	T	L	G	V	A	V	V	M	L	L	M	V	P	W	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	M	I	A	T	P	E	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand