Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52101 Date Thu Jan 5 12:05:19 GMT 2012 Unique Job ID 88d083dd7203ec95

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	W	P	V	F	P	R	S	L	R	Q	L	V	M	L	A	F	L	L	I	L	L	P	L	L	V	L	A	W	Q	A	W	Q	S	L	N	A	L	S	D	Q	A	A	L	V	N	R	T	T	L	I	D	A	R	R	S	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	T	N	A	A	L	E	M	E	R	S	Y	R	Q	Y	C	V	L	D	D	P	T	L	A	K	V	Y	Q	S	Q	R	K	R	Y	S	E	M	L	D	A	H	A	G	V	L	P	D	D	K	L	Y	Q	A	L	R	Q	D	L	H	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	Q	L	Q	C	N	N	S	G	P	D	A	A	A	A	A	R	L	E	A	F	A	S	A	N	T	E	M	V	Q	A	T	R	T	V	V	F	S	R	G	Q	Q	L	Q	R	E	I	A	E	R	G	Q	Y	F	G	W	Q	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	L	F	L	V	S	L	V	M	V	L	L	F	T	R	M	I	I	G	P	V	K	N	I	E	R	M	I	N	R	L	G	E	G	R	S	L	G	N	S	V	S	F	S	G	P	S	E	L	R	S	V	G	Q	R	I	L	W	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	R	L	S	W	L	E	S	Q	R	H	Q	F	L	R	H	L	S	H	E	L	K	T	P	L	A	S	M	R	E	G	T	E	L	L	A	D	Q	V	V	G	P	L	T	P	E	Q	K	E	V	V	S	I	L	D	S	S	S	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Q	K	L	I	E	Q	L	L	D	Y	N	R	K	Q	A	D	S	A	V	E	L	E	N	V	E	L	A	P	L	V	E	T	V	V	S	A	H	S	L	P	A	R	A	K	M	M	H	T	D	V	D	L	K	A	T	A	C	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?			?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	P	M	L	L	M	S	V	L	D	N	L	Y	S	N	A	V	H	Y	G	A	E	S	G	N	I	C	L	R	S	S	L	H	G	A	R	V	Y	I	D	V	I	N	T	G	T	P	I	P	Q	E	E	R	A	M	I	F	E	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Sequence		F	Q	G	S	H	Q	R	K	G	A	V	K	G	S	G	L	G	L	S	I	A	R	D	C	I	R	R	M	Q	G	E	L	Y	L	V	D	E	S	G	Q	D	V	C	F	R	I	E	L	P	S	S	K	N	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand