Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30850 Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Unique Job ID 8850cac2b6037c84

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	Q	D	N	P	L	L	A	Q	L	K	Q	Q	L	H	S	Q	T	P	R	A	E	G	V	V	K	A	T	E	K	G	F	G	F	L	E	V	D	A	Q	K	S	Y	F	I	P	P	P	Q	M	K	K	V	M	H	G	D	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	A	V	I	H	S	E	K	E	R	E	S	A	E	P	E	E	L	V	E	P	F	L	T	R	F	V	G	K	V	Q	G	K	N	D	R	L	A	I	V	P	D	H	P	L	L	K	D	A	I	P	C	R	A	A	R	G	L	N	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?																																												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	F	K	E	G	D	W	A	V	A	E	M	R	R	H	P	L	K	G	D	R	S	F	Y	A	E	L	T	Q	Y	I	T	F	G	D	D	H	F	V	P	W	W	V	T	L	A	R	H	N	L	E	K	E	A	P	D	G	V	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	M	L	D	E	G	L	V	R	E	D	L	T	A	L	D	F	V	T	I	D	S	A	S	T	E	D	M	D	D	A	L	F	A	K	A	L	P	D	D	K	L	Q	L	I	V	A	I	A	D	P	T	A	W	I	A	E	G	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	D	K	A	A	K	I	R	A	F	T	N	Y	L	P	G	F	N	I	P	M	L	P	R	E	L	S	D	D	L	C	S	L	R	A	N	E	V	R	P	V	L	A	C	R	M	T	L	S	A	D	G	T	I	E	D	N	I	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	A	A	T	I	E	S	K	A	K	L	V	Y	D	Q	V	S	D	W	L	E	N	T	G	D	W	Q	P	E	S	E	A	I	A	E	Q	V	R	L	L	A	Q	I	C	Q	R	R	G	E	W	R	H	N	H	A	L	V	F	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	P	D	Y	R	F	I	L	G	E	K	G	E	V	L	D	I	V	A	E	P	R	R	I	A	N	R	I	V	E	E	A	M	I	A	A	N	I	C	A	A	R	V	L	R	D	K	L	G	F	G	I	Y	N	V	H	M	G	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	A	N	A	D	A	L	A	A	L	L	K	T	H	G	L	H	V	D	A	E	E	V	L	T	L	D	G	F	C	K	L	R	R	E	L	D	A	Q	P	T	G	F	L	D	S	R	I	R	R	F	Q	S	F	A	E	I	S	T	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?												?																	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	G	P	H	F	G	L	G	L	E	A	Y	A	T	W	T	S	P	I	R	K	Y	G	D	M	I	N	H	R	L	L	K	A	V	I	K	G	E	T	A	T	R	P	Q	D	E	I	T	V	Q	M	A	E	R	R	R	L	N	R	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	E	R	D	V	G	D	W	L	Y	A	R	F	L	K	D	K	A	G	T	D	T	R	F	A	A	E	I	V	D	I	S	R	G	G	M	R	V	R	L	V	D	N	G	A	I	A	F	I	P	A	P	F	L	H	A	V	R	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Sequence		L	V	C	S	Q	E	N	G	T	V	Q	I	K	G	E	T	V	Y	K	V	T	D	V	I	D	V	T	I	A	E	V	R	M	E	T	R	S	I	I	A	R	P	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?		?								?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand