Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P63883 Date Thu Jan 5 12:08:11 GMT 2012 Unique Job ID 8822b125cc504c4b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	S	N	T	A	I	S	R	R	R	L	L	Q	G	A	G	A	M	W	L	L	S	V	S	Q	V	S	L	A	A	V	S	Q	V	V	A	V	R	V	W	P	A	S	S	Y	T	R	V	T	V	E	S	N	R	Q	L	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	Q	F	A	L	S	N	P	E	R	V	V	V	D	I	E	D	V	N	L	N	S	V	L	K	G	M	A	A	Q	I	R	A	D	D	P	F	I	K	S	A	R	V	G	Q	F	D	P	Q	T	V	R	M	V	F	E	L	K	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	K	P	Q	L	F	A	L	A	P	V	A	G	F	K	E	R	L	V	M	D	L	Y	P	A	N	A	Q	D	M	Q	D	P	L	L	A	L	L	E	D	Y	N	K	G	D	L	E	K	Q	V	P	P	A	Q	S	G	P	Q	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?					?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	A	G	R	D	R	P	I	V	I	M	L	D	P	G	H	G	G	E	D	S	G	A	V	G	K	Y	K	T	R	E	K	D	V	V	L	Q	I	A	R	R	L	R	S	L	I	E	K	E	G	N	M	K	V	Y	M	T	R	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	I	F	I	P	L	Q	V	R	V	A	K	A	Q	K	Q	R	A	D	L	F	V	S	I	H	A	D	A	F	T	S	R	Q	P	S	G	S	S	V	F	A	L	S	T	K	G	A	T	S	T	A	A	K	Y	L	A	Q	T	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?													?	?	?	?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	S	D	L	I	G	G	V	S	K	S	G	D	R	Y	V	D	H	T	M	F	D	M	V	Q	S	L	T	I	A	D	S	L	K	F	G	K	A	V	L	N	K	L	G	K	I	N	K	L	H	K	N	Q	V	E	Q	A	G	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?																			?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	L	K	A	P	D	I	P	S	I	L	V	E	T	A	F	I	S	N	V	E	E	E	R	K	L	K	T	A	T	F	Q	Q	E	V	A	E	S	I	L	A	G	I	K	A	Y	F	A	D	G	A	T	L	A	R	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand