Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24216 Date Thu Jan 5 11:41:19 GMT 2012 Unique Job ID 881f53d646e6c06b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	S	I	S	S	L	G	V	G	S	G	L	D	L	S	S	I	L	D	S	L	T	A	A	Q	K	A	T	L	T	P	I	S	N	Q	Q	S	S	F	T	A	K	L	S	A	Y	G	T	L	K	S	A	L	T	T	F	Q	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	T	A	L	S	K	A	D	L	F	S	A	T	S	T	T	S	S	T	T	A	F	S	A	T	T	A	G	N	A	I	A	G	K	Y	T	I	S	V	T	H	L	A	Q	A	Q	T	L	T	T	R	T	T	R	D	D	T	K	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	A	T	S	D	S	K	L	T	I	Q	Q	G	G	D	K	D	P	I	T	I	D	I	S	A	A	N	S	S	L	S	G	I	R	D	A	I	N	N	A	K	A	G	V	S	A	S	I	I	N	V	G	N	G	E	Y	R	L	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?														?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	S	N	D	T	G	L	D	N	A	M	T	L	S	V	S	G	D	D	A	L	Q	S	F	M	G	Y	D	A	S	A	S	S	N	G	M	E	V	S	V	A	A	Q	N	A	Q	L	T	V	N	N	V	A	I	E	N	S	S	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	S	D	A	L	E	N	I	T	L	N	L	N	D	V	T	T	G	N	Q	T	L	T	I	T	Q	D	T	S	K	A	Q	T	A	I	K	D	W	V	N	A	Y	N	S	L	I	D	T	F	S	S	L	T	K	Y	T	A	V	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?											?	?	?	?	?	?						?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	D	S	Q	S	S	S	N	G	A	L	L	G	D	S	T	L	R	T	I	Q	T	Q	L	K	S	M	L	S	N	T	V	S	S	S	S	Y	K	T	L	A	Q	I	G	I	T	T	D	P	S	D	G	K	L	E	L	D	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	L	T	A	A	L	K	K	D	A	S	G	V	G	A	L	I	V	G	D	G	K	K	T	G	I	T	T	T	I	G	S	N	L	T	S	W	L	S	T	T	G	I	I	K	A	A	T	D	G	V	S	K	T	L	N	K	L	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?	?									?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		D	Y	N	A	A	S	D	R	I	D	A	Q	V	A	R	Y	K	E	Q	F	T	Q	L	D	V	L	M	T	S	L	N	S	T	S	S	Y	L	T	Q	Q	F	E	N	N	S	N	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand