Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P17846 Date Thu Jan 5 11:36:18 GMT 2012 Unique Job ID 86e2e456c6a8d4b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	K	H	P	G	P	L	V	V	E	G	K	L	T	D	A	E	R	M	K	H	E	S	N	Y	L	R	G	T	I	A	E	D	L	N	D	G	L	T	G	G	F	K	G	D	N	F	L	L	I	R	F	H	G	M	Y	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?			?	?																?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	D	R	D	I	R	A	E	R	A	E	Q	K	L	E	P	R	H	A	M	L	L	R	C	R	L	P	G	G	V	I	T	T	K	Q	W	Q	A	I	D	K	F	A	G	E	N	T	I	Y	G	S	I	R	L	T	N	R	Q	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	F	H	G	I	L	K	K	N	V	K	P	V	H	Q	M	L	H	S	V	G	L	D	A	L	A	T	A	N	D	M	N	R	N	V	L	C	T	S	N	P	Y	E	S	Q	L	H	A	E	A	Y	E	W	A	K	K	I	S	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	P	R	T	R	A	Y	A	E	I	W	L	D	Q	E	K	V	A	T	T	D	E	E	P	I	L	G	Q	T	Y	L	P	R	K	F	K	T	T	V	V	I	P	P	Q	N	D	I	D	L	H	A	N	D	M	N	F	V	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?					?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	E	N	G	K	L	V	G	F	N	L	L	V	G	G	G	L	S	I	E	H	G	N	K	K	T	Y	A	R	T	A	S	E	F	G	Y	L	P	L	E	H	T	L	A	V	A	E	A	V	V	T	T	Q	R	D	W	G	N	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	R	K	N	A	K	T	K	Y	T	L	E	R	V	G	V	E	T	F	K	A	E	V	E	R	R	A	G	I	K	F	E	P	I	R	P	Y	E	F	T	G	R	G	D	R	I	G	W	V	K	G	I	D	D	N	W	H	L	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	I	E	N	G	R	I	L	D	Y	P	A	R	P	L	K	T	G	L	L	E	I	A	K	I	H	K	G	D	F	R	I	T	A	N	Q	N	L	I	I	A	G	V	P	E	S	E	K	A	K	I	E	K	I	A	K	E	S	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	N	A	V	T	P	Q	R	E	N	S	M	A	C	V	S	F	P	T	C	P	L	A	M	A	E	A	E	R	F	L	P	S	F	I	D	N	I	D	N	L	M	A	K	H	G	V	S	D	E	H	I	V	M	R	V	T	G	C	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	G	C	G	R	A	M	L	A	E	V	G	L	V	G	K	A	P	G	R	Y	N	L	H	L	G	G	N	R	I	G	T	R	I	P	R	M	Y	K	E	N	I	T	E	P	E	I	L	A	S	L	D	E	L	I	G	R	W	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Sequence		E	R	E	A	G	E	G	F	G	D	F	T	V	R	A	G	I	I	R	P	V	L	D	P	A	R	D	L	W	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																					?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand