Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75857 Date Thu Jan 5 12:15:06 GMT 2012 Unique Job ID 85780871e9a51a49

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	R	T	H	R	Q	H	S	L	L	S	S	G	G	V	P	S	F	I	G	G	L	V	V	F	V	S	A	A	F	N	A	Q	A	E	T	W	F	D	P	A	F	F	K	D	D	P	S	M	V	A	D	L	S	R	F	E	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	K	I	T	P	G	V	Y	R	V	D	I	V	L	N	Q	T	I	V	D	T	R	N	V	N	F	V	E	I	T	P	E	K	G	I	A	A	C	L	T	T	E	S	L	D	A	M	G	V	N	T	D	A	F	P	A	F	K	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																										?																						?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	K	Q	A	C	V	P	L	A	E	I	I	P	D	A	S	V	T	F	N	V	N	K	L	R	L	E	I	S	V	P	Q	I	A	I	K	S	N	A	R	G	Y	V	P	P	E	R	W	D	E	G	I	N	A	L	L	L	G	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																						?														?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	S	G	A	N	S	I	H	S	S	A	D	S	D	S	G	D	S	Y	F	L	N	L	N	S	G	V	N	L	G	P	W	R	L	R	N	N	S	T	W	S	R	S	S	G	Q	T	A	E	W	K	N	L	S	S	Y	L	Q	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	I	P	L	K	G	E	L	T	V	G	D	D	Y	T	A	G	D	F	F	D	S	V	S	F	R	G	V	Q	L	A	S	D	D	N	M	L	P	D	S	L	K	G	F	A	P	V	V	R	G	I	A	K	S	N	A	Q	I	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?											?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	Q	N	G	Y	T	I	Y	Q	T	Y	V	S	P	G	A	F	E	I	S	D	L	Y	S	T	S	S	S	G	D	L	L	V	E	I	K	E	A	D	G	S	V	N	S	Y	S	V	P	F	S	S	V	P	L	L	Q	R	Q	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	K	Y	A	V	T	L	A	K	Y	R	T	N	S	N	E	Q	Q	E	S	K	F	A	Q	A	T	L	Q	W	G	G	P	W	G	T	T	W	Y	G	G	G	Q	Y	A	E	Y	Y	R	A	A	M	F	G	L	G	F	N	L	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	G	A	I	S	F	D	A	T	Q	A	K	S	T	L	A	D	Q	S	E	H	K	G	Q	S	Y	R	F	L	Y	A	K	T	L	N	H	L	G	T	N	F	Q	L	M	G	Y	R	Y	S	T	S	G	F	Y	T	L	S	D	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?			?		?	?													?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	K	H	M	D	G	Y	E	F	N	D	G	D	D	E	D	T	P	M	W	S	R	Y	Y	N	L	F	Y	T	K	R	G	K	L	Q	V	N	I	S	Q	Q	L	G	E	Y	G	S	F	Y	L	S	G	S	Q	Q	T	Y	W	H	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		D	Q	Q	D	R	L	L	Q	F	G	Y	N	T	Q	I	K	D	L	S	L	G	I	S	W	N	Y	S	K	S	R	G	Q	P	D	A	D	Q	V	F	A	L	N	F	S	L	P	L	N	L	L	L	P	R	S	N	D	S	Y	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	K	N	Y	A	W	M	T	S	N	T	S	I	D	N	E	G	H	T	T	Q	N	L	G	L	T	E	T	L	L	D	D	G	N	L	S	Y	S	V	Q	Q	G	Y	N	S	E	G	K	T	A	N	G	S	A	S	M	D	Y	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?									?			?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		A	F	A	D	A	R	V	G	Y	N	Y	S	D	N	G	S	Q	Q	Q	L	N	Y	A	L	S	G	S	L	V	A	H	S	Q	G	I	T	L	G	Q	S	L	G	E	T	N	V	L	I	A	A	P	G	A	E	N	T	R	V	A	N
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		S	T	G	L	K	T	D	W	R	G	Y	T	V	V	P	Y	A	T	S	Y	R	E	N	R	I	A	L	D	A	A	S	L	K	R	N	V	D	L	E	N	A	V	V	N	V	V	P	T	K	G	A	L	V	L	A	E	F	N	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																		?										?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		A	G	A	R	V	L	M	K	T	S	K	Q	G	I	P	L	R	F	G	A	I	A	T	L	D	G	V	Q	A	N	S	G	I	I	D	D	D	G	S	L	Y	M	A	G	L	P	A	K	G	T	I	S	V	R	W	G	E	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																							?	?																					?	?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	I	C	H	I	N	Y	E	L	T	E	Q	Q	I	N	S	A	I	T	R	M	D	A	I	C	R
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Disorder		?											?	?	?	?	?									?	?
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