Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76389 Date Thu Jan 5 12:22:30 GMT 2012 Unique Job ID 8569430555d9e71d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	W	I	A	D	P	S	I	W	A	G	L	I	T	L	I	V	I	E	L	V	L	G	I	D	N	L	V	F	I	A	I	L	A	E	K	L	P	P	K	Q	R	D	R	A	R	V	T	G	L	L	L	A	M	L	M	R	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																														?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	L	A	S	I	S	W	L	V	T	L	T	Q	P	L	F	S	F	R	S	F	T	F	S	A	R	D	L	I	M	L	F	G	G	F	F	L	L	F	K	A	T	M	E	L	N	E	R	L	E	G	K	D	S	N	N	P	T	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?																																								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	G	A	K	F	W	G	V	V	T	Q	I	V	V	L	D	A	I	F	S	L	D	S	V	I	T	A	V	G	M	V	D	H	L	L	V	M	M	A	A	V	V	I	A	I	S	L	M	L	M	A	S	K	P	L	T	Q	F	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	H	P	T	I	V	I	L	C	L	S	F	L	L	M	I	G	F	S	L	V	A	E	G	F	G	F	V	I	P	K	G	Y	L	Y	A	A	I	G	F	S	V	M	I	E	A	L	N	Q	L	A	I	F	N	R	R	R	F	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	N	Q	T	L	R	Q	R	T	T	E	A	V	M	R	L	L	S	G	Q	K	E	D	A	E	L	D	A	E	T	A	S	M	L	V	D	H	G	N	Q	Q	I	F	N	P	Q	E	R	R	M	I	E	R	V	L	N	L	N	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?												?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	S	S	I	M	T	S	R	H	D	I	E	H	I	D	L	N	A	P	E	E	E	I	R	Q	L	L	E	R	N	Q	H	T	R	L	V	V	T	D	G	D	D	A	E	D	L	L	G	V	V	H	V	I	D	L	L	Q	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	R	G	E	P	L	N	L	R	V	L	I	R	Q	P	L	V	F	P	E	T	L	P	L	L	P	A	L	E	Q	F	R	N	A	R	T	H	F	A	F	V	V	D	E	F	G	S	V	E	G	I	V	T	L	S	D	V	T	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	A	G	N	L	P	N	E	V	E	E	I	D	A	R	H	D	I	Q	K	N	A	D	G	S	W	T	A	N	G	H	M	P	L	E	D	L	V	Q	Y	V	P	L	P	L	D	E	K	R	E	Y	H	T	I	A	G	L	L	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	L	Q	R	I	P	K	P	G	E	E	V	Q	V	G	D	Y	L	L	K	T	L	Q	V	E	S	H	R	V	Q	K	V	Q	I	I	P	L	R	K	D	G	E	M	E	Y	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand