Phyre 2 Results for P39180

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P39180
Date	Thu Jan 5 11:58:24 GMT 2012
Unique Job ID	84345fea00e2cb4c

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M K R H L N T C Y R L V W N H M T G A F V V A S E L A R A R G K R G G V A V A L S L A A V T S L P V L A A D I V V H P G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence E T V N G G T L A N H D N Q I V F G T T N G M T I S T G L E Y G P D N E A N T G G Q W V Q D G G T A N K T T V T S G G L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
?
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? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence Q R V N P G G S V S D T V I S A G G G Q S L Q G R A V N T T L N G G E Q W M H E G A I A T G T V I N D K G W Q V V K P G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence T V A T D T V V N T G A E G G P D A E N G D T G Q F V R G D A V R T T I N K N G R Q I V R A E G T A N T T V V Y A G G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence Q T V H G H A L D T T L N G G Y Q Y V H N G G T A S D T V V N S D G W Q I V K N G G V A G N T T V N Q K G R L Q V D A G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence G T A T N V T L K Q G G A L V T S T A A T V T G I N R L G A F S V V E G K A D N V V L E N G G R L D V L T G H T A T N T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
? ?
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? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence R V D D G G T L D V R N G G T A T T V S M G N G G V L L A D S G A A V S G T R S D G K A F S I G G G Q A D A L M L E K G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
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?
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence S S F T L N A G D T A T D T T V N G G L F T A R G G T L A G T T T L N N G A I L T L S G K T V N N D T L T I R E G D A L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ?
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? ? ?
? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence L Q G G S L T G N G S V E K S G S G T L T V S N T T L T Q K A V N L N E G T L T L N D S T V T T D V I A Q R G T A L K L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence T G S T V L N G A I D P T N V T L A S G A T W N I P D N A T V Q S V V D D L S H A G Q I H F T S T R T G K F V P A T L K

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence V K N L N G Q N G T I S L R V R P D M A Q N N A D R L V I D G G R A T G K T I L N L V N A G N S A S G L A T S G K G I Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence V V E A I N G A T T E E G A F V Q G N R L Q A G A F N Y S L N R D S D E S W Y L R S E N A Y R A E V P L Y A S M L T Q A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence M D Y D R I V A G S R S H Q T G V N G E N N S V R L S I Q G G H L G H D N N G G I A R G A T P E S S G S Y G F V R L E G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence D L M R T E V A G M S V T A G V Y G A A G H S S V D V K D D D G S R A G T V R D D A G S L G G Y L N L V H T S S G L W A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence D I V A Q G T R H S M K A S S D N N D F R A R G W G W L G S L E T G L P F S I T D N L M L E P Q L Q Y T W Q G L S L D D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence G K D N A G Y V K F G H G S A Q H V R A G F R L G S H N D M T F G E G T S S R A P L R D S A K H S V S E L P V N W W V Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence P S V I R T F S S R G D M R V G T S T A G S G M T F S P S Q N G T S L D L Q A G L E A R V R E N I T L G V Q A G Y A H S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . .

Sequence V S G S S A E G Y N G Q A T L N V T F

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand