Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31433 Date Thu Jan 5 11:47:23 GMT 2012 Unique Job ID 841ddba48408f054

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	F	I	G	K	L	L	L	Y	I	L	I	A	L	L	V	A	I	A	G	L	Y	F	L	L	Q	T	R	W	G	A	E	H	I	S	A	W	V	S	E	N	S	D	Y	H	L	A	F	G	A	M	D	H	R	F	S	A	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	I	V	L	E	N	V	T	F	G	R	D	G	Q	P	A	T	L	V	A	K	S	V	D	I	A	L	S	S	R	Q	L	T	E	P	R	H	V	D	T	I	L	L	E	N	G	T	L	N	L	T	D	Q	T	A	P	L	P	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?	?	?	?	?				?									?	?	?	?	?		?		?											?				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	R	L	Q	L	R	D	M	A	F	N	S	P	N	S	E	W	K	L	S	A	Q	R	V	N	G	G	V	V	P	W	S	P	K	A	G	K	V	L	G	T	K	A	Q	I	Q	F	S	A	G	S	L	S	L	N	D	V	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?			?	?	?	?		?		?	?	?		?	?					?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	N	V	L	I	E	G	S	I	D	N	D	R	V	T	L	T	N	L	G	A	D	I	A	R	G	T	L	T	G	N	A	Q	R	N	A	D	G	S	W	Q	V	E	N	L	R	M	A	D	I	R	L	Q	S	E	K	S	L	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?														?					?	?			?	?	?	?										?			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	F	A	P	L	R	S	V	P	S	L	Q	I	G	R	L	E	V	I	D	A	R	L	Q	G	P	D	W	A	V	T	D	L	D	L	S	L	R	N	M	T	F	S	K	D	D	W	Q	T	Q	E	G	K	L	S	M	N	A	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?					?			?		?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	I	Y	G	S	L	H	L	F	D	P	I	I	N	T	E	F	S	P	Q	G	V	A	L	R	Q	F	T	S	R	W	E	G	G	M	V	R	T	S	G	N	W	L	R	D	G	K	T	L	I	L	D	D	A	A	I	A	G	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?	?	?	?						?	?						?								?	?							?	?	?	?	?	?				?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	T	L	P	K	N	W	Q	Q	L	W	M	E	T	T	P	G	W	L	N	S	L	Q	L	K	R	F	S	A	S	R	N	L	I	I	D	I	D	P	D	F	P	W	Q	L	T	A	L	D	G	Y	G	A	N	L	T	L	V	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?	?	?	?	?	?		?	?		?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	K	W	G	V	W	S	G	S	A	N	L	N	A	A	A	A	T	F	N	R	V	D	V	R	R	P	S	L	A	L	T	A	N	S	S	T	V	N	I	S	E	L	S	A	F	T	E	K	G	I	L	E	A	T	A	S	V	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?								?					?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	P	Q	R	Q	T	H	I	S	L	N	G	R	G	V	P	V	N	I	L	Q	Q	W	G	W	P	E	L	P	L	T	G	D	G	N	I	Q	L	T	A	S	G	D	I	Q	A	N	V	P	L	K	P	T	V	S	G	Q	L	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?		?		?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	N	A	A	K	Q	Q	V	T	Q	T	M	N	A	G	I	V	S	S	G	E	V	T	S	T	E	P	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand