Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46802 Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Unique Job ID 82810ccb12125ae1

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	L	A	T	T	Q	S	V	L	M	Q	I	Q	P	T	I	Q	R	F	A	R	M	L	A	S	V	L	Q	L	E	V	E	I	V	D	E	N	L	C	R	V	A	G	T	G	A	Y	G	K	F	L	G	R	Q	L	S	G	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	L	L	R	H	V	L	E	T	K	T	E	K	V	V	T	Q	S	R	F	D	P	L	C	E	G	C	D	S	K	E	N	C	R	E	K	A	F	L	G	T	P	V	I	L	Q	D	R	C	V	G	V	I	S	L	I	A	V	T	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	Q	Q	E	H	I	S	D	N	L	R	E	F	S	D	Y	V	R	H	I	S	T	I	F	V	S	K	L	L	E	D	Q	G	P	G	D	N	I	S	K	I	F	A	T	M	I	D	N	M	D	Q	G	V	L	V	V	D	D	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	V	Q	F	V	N	Q	T	A	L	K	T	L	G	V	V	Q	N	N	I	I	G	K	P	I	R	F	R	P	L	T	F	E	S	N	F	T	H	G	H	M	Q	H	I	V	S	W	D	D	K	S	E	L	I	I	G	Q	L	H	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	Q	G	R	Q	L	F	L	M	A	F	H	Q	S	H	T	S	F	S	V	A	N	A	P	D	E	P	H	I	E	Q	L	V	G	E	C	R	V	M	R	Q	L	K	R	L	I	S	R	I	A	P	S	P	S	S	V	M	V	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	S	G	T	G	K	E	V	V	A	R	A	I	H	K	L	S	G	R	R	N	K	P	F	I	A	I	N	C	A	A	I	P	E	Q	L	L	E	S	E	L	F	G	Y	V	K	G	A	F	T	G	A	S	A	N	G	K	T	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	Q	A	A	N	T	G	T	L	F	L	D	E	I	G	D	M	P	L	M	L	Q	A	K	L	L	R	A	I	E	A	R	E	I	L	P	I	G	A	S	S	P	I	Q	V	D	I	R	I	I	S	A	T	N	Q	N	L	A	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	A	E	G	K	F	R	E	D	L	F	Y	R	L	N	V	I	P	I	T	L	P	P	L	R	E	R	Q	E	D	I	E	L	L	V	H	Y	F	L	H	L	H	T	R	R	L	G	S	V	Y	P	G	I	A	P	D	V	V	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?																																									?			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	R	K	H	R	W	P	G	N	L	R	E	L	S	N	L	M	E	Y	L	V	N	V	V	P	S	G	E	V	I	D	S	T	L	L	P	P	N	L	L	N	N	G	T	T	E	Q	S	D	V	T	E	V	S	E	A	H	L	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Sequence		D	D	A	G	G	T	A	L	E	E	M	E	K	Q	M	I	R	E	A	L	S	R	H	N	S	K	K	Q	V	A	D	E	L	G	I	G	I	A	T	L	Y	R	K	I	K	K	Y	E	L	L	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand