Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39338 Date Thu Jan 5 11:59:30 GMT 2012 Unique Job ID 81fca6b81e19a91d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	V	I	N	E	M	D	V	P	S	H	S	F	V	F	H	G	T	G	E	R	Y	F	L	I	C	V	V	N	V	L	L	T	I	I	T	L	G	I	Y	L	P	W	A	L	M	K	C	K	R	Y	L	Y	A	N	M	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	G	Q	R	F	S	Y	G	I	T	G	G	N	V	F	V	S	C	L	F	F	V	F	F	Y	F	A	I	L	M	T	V	S	A	D	M	P	L	V	G	C	V	L	T	L	L	L	L	V	L	L	I	F	M	A	A	K	G	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	Q	A	L	M	T	S	L	N	G	V	R	F	S	F	N	C	S	M	K	G	F	W	W	V	T	F	F	L	P	I	L	M	A	I	G	M	G	T	V	F	F	I	S	T	K	M	L	P	A	N	S	S	S	S	V	I	I	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	L	M	A	I	V	G	I	V	S	I	G	I	F	N	G	T	L	Y	S	L	V	M	S	F	L	W	S	N	T	S	F	G	I	H	R	F	K	V	K	L	D	T	T	Y	C	I	K	Y	A	I	L	A	F	L	A	L	L	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	A	V	A	G	Y	I	I	F	D	Q	I	L	N	A	Y	D	S	S	V	Y	A	N	D	D	I	E	N	L	Q	Q	F	M	E	M	Q	R	K	M	I	I	A	Q	L	I	Y	Y	F	G	I	A	V	S	T	S	Y	L	T	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	R	N	H	F	M	S	N	L	S	L	N	D	G	R	I	R	F	R	L	T	L	T	Y	H	G	M	L	Y	R	M	C	A	L	V	V	I	S	G	I	T	G	G	L	A	Y	P	L	L	K	I	W	M	I	D	W	Q	A	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	Y	L	L	G	D	L	D	D	L	P	L	I	N	K	E	E	Q	P	D	K	G	F	L	A	S	I	S	R	G	V	M	P	S	L	P	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand