Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24177 Date Wed Jan 25 15:20:44 GMT 2012 Unique Job ID 8137cd87d7d9248b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	N	F	F	I	D	R	P	I	F	A	W	V	L	A	I	L	L	C	L	T	G	T	L	A	I	F	S	L	P	V	E	Q	Y	P	D	L	A	P	P	N	V	R	V	T	A	N	Y	P	G	A	S	A	Q	T	L	E	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	T	Q	V	I	E	Q	N	M	T	G	L	D	N	L	M	Y	M	S	S	Q	S	S	G	T	G	Q	A	S	V	T	L	S	F	K	A	G	T	D	P	D	E	A	V	Q	Q	V	Q	N	Q	L	Q	S	A	M	R	K	L	P	Q
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SS confidence
Disorder												?	?	?		?	?							?	?	?	?																															?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	Q	N	Q	G	V	T	V	R	K	T	G	D	T	N	I	L	T	I	A	F	V	S	T	D	G	S	M	D	K	Q	D	I	A	D	Y	V	A	S	N	I	Q	D	P	L	S	R	V	N	G	V	G	D	I	D	A	Y	G	S
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Disorder			?			?						?	?			?										?		?	?																				?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Y	S	M	R	I	W	L	D	P	A	K	L	N	S	F	Q	M	T	A	K	D	V	T	D	A	I	E	S	Q	N	A	Q	I	A	V	G	Q	L	G	G	T	P	S	V	D	K	Q	A	L	N	A	T	I	N	A	Q	S	L	L
Secondary structure
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Disorder																	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	T	P	E	Q	F	R	D	I	T	L	R	V	N	Q	D	G	S	E	V	R	L	G	D	V	A	T	V	E	M	G	A	E	K	Y	D	Y	L	S	R	F	N	G	K	P	A	S	G	L	G	V	K	L	A	S	G	A	N	E	M
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Disorder													?	?																					?	?	?																		?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	T	A	E	L	V	L	N	R	L	D	E	L	A	Q	Y	F	P	H	G	L	E	Y	K	V	A	Y	E	T	T	S	F	V	K	A	S	I	E	D	V	V	K	T	L	L	E	A	I	A	L	V	F	L	V	M	Y	L	F	L	Q
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Disorder																	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	F	R	A	T	L	I	P	T	I	A	V	P	V	V	L	M	G	T	F	S	V	L	Y	A	F	G	Y	S	V	N	T	L	T	M	F	A	M	V	L	A	I	G	L	L	V	D	D	A	I	V	V	V	E	N	V	E	R	I	M
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	E	E	G	L	T	P	R	E	A	T	R	K	S	M	G	Q	I	Q	G	A	L	V	G	I	A	M	V	L	S	A	V	F	V	P	M	A	F	F	G	G	T	T	G	A	I	Y	R	Q	F	S	I	T	I	V	A	A	M	V	L
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Disorder				?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	V	L	V	A	M	I	L	T	P	A	L	C	A	T	L	L	K	P	L	K	K	G	E	H	H	G	Q	K	G	F	F	A	W	F	N	Q	M	F	N	R	N	A	E	R	Y	E	K	G	V	A	K	I	L	H	R	S	L	R	W
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	V	I	Y	V	L	L	L	G	G	M	V	F	L	F	L	R	L	P	T	S	F	L	P	L	E	D	R	G	M	F	T	T	S	V	Q	L	P	S	G	S	T	Q	Q	Q	T	L	K	V	V	E	Q	I	E	K	Y	Y	F	T	H
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	K	D	N	I	M	S	V	F	A	T	V	G	S	G	P	G	G	N	G	Q	N	V	A	R	M	F	I	R	L	K	D	W	S	E	R	D	S	K	T	G	T	S	F	A	I	I	E	R	A	T	K	A	F	N	Q	I	K	E	A
Secondary structure
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Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		R	V	I	A	S	S	P	P	A	I	S	G	L	G	S	S	A	G	F	D	M	E	L	Q	D	H	A	G	A	G	H	D	A	L	M	A	A	R	N	Q	L	L	A	L	A	A	E	N	P	E	L	T	R	V	R	H	N	G	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?																					?					?		?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	S	P	Q	L	Q	I	D	I	D	Q	R	K	A	Q	A	L	G	V	A	I	D	D	I	N	D	T	L	Q	T	A	W	G	S	S	Y	V	N	D	F	M	D	R	G	R	V	K	K	V	Y	V	Q	A	A	A	P	Y	R	M	L
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Disorder			?																														?																										?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		P	D	D	I	N	L	W	Y	V	R	N	K	D	G	G	M	V	P	F	S	A	F	A	T	S	R	W	E	T	G	S	P	R	L	E	R	Y	N	G	Y	S	A	V	E	I	V	G	E	A	A	P	G	V	S	T	G	T	A	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?					?				?	?				?									?	?	?	?	?						?	?	?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		I	M	E	S	L	V	K	Q	L	P	N	G	F	G	L	E	W	T	A	M	S	Y	Q	E	R	L	S	G	A	Q	A	P	A	L	Y	A	I	S	L	L	V	V	F	L	C	L	A	A	L	Y	E	S	W	S	V	P	F	S	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		L	V	V	P	L	G	V	I	G	A	L	L	A	T	W	M	R	G	L	E	N	D	V	Y	F	Q	V	G	L	L	T	V	I	G	L	S	A	K	N	A	I	L	I	V	E	F	A	N	E	M	N	Q	K	G	H	D	L	F	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?																																?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		T	L	H	A	C	R	Q	R	L	R	P	I	L	M	T	S	L	A	F	I	F	G	V	L	P	M	A	T	S	T	G	A	G	S	G	G	Q	H	A	V	G	T	G	V	M	G	G	M	I	S	A	T	I	L	A	I	Y	F	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	F	F	V	L	V	R	R	R	F	P	L	K	P	R	P	E
Secondary structure
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Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?
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