Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46916 Date Thu Jan 5 12:35:51 GMT 2012 Unique Job ID 80d93fe5e54c0347

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	L	S	Q	A	A	S	S	V	E	K	R	T	N	A	R	Y	W	I	V	V	M	L	F	I	V	T	S	F	N	Y	G	D	R	A	T	L	S	I	A	G	S	E	M	A	K	D	I	G	L	D	P	V	G	M	G	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	S	A	F	S	W	A	Y	V	I	G	Q	I	P	G	G	W	L	L	D	R	F	G	S	K	R	V	Y	F	W	S	I	F	I	W	S	M	F	T	L	L	Q	G	F	V	D	I	F	S	G	F	G	I	I	V	A	L	F	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	F	L	V	G	L	A	E	A	P	S	F	P	G	N	S	R	I	V	A	A	W	F	P	A	Q	E	R	G	T	A	V	S	I	F	N	S	A	Q	Y	F	A	T	V	I	F	A	P	I	M	G	W	L	T	H	E	V	G	W	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		H	V	F	F	F	M	G	G	L	G	I	V	I	S	F	I	W	L	K	V	I	H	E	P	N	Q	H	P	G	V	N	K	K	E	L	E	Y	I	A	A	G	G	A	L	I	N	M	D	Q	Q	N	T	K	V	K	V	P	F	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	W	G	Q	I	K	Q	L	L	G	S	R	M	M	I	G	V	Y	I	G	Q	Y	C	I	N	A	L	T	Y	F	F	I	T	W	F	P	V	Y	L	V	Q	A	R	G	M	S	I	L	K	A	G	F	V	A	S	V	P	A	V	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	F	I	G	G	V	L	G	G	I	I	S	D	W	L	M	R	R	T	G	S	L	N	I	A	R	K	T	P	I	V	M	G	M	L	L	S	M	V	M	V	F	C	N	Y	V	N	V	E	W	M	I	I	G	F	M	A	L	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	G	K	G	I	G	A	L	G	W	A	V	M	A	D	T	A	P	K	E	I	S	G	L	S	G	G	L	F	N	M	F	G	N	I	S	G	I	V	T	P	I	A	I	G	Y	I	V	G	T	T	G	S	F	N	G	A	L	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Sequence		V	G	V	H	A	L	I	A	V	L	S	Y	L	V	L	V	G	D	I	K	R	I	E	L	K	P	V	A	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand