Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37659 Date Thu Jan 5 11:56:31 GMT 2012 Unique Job ID 804ef033dba2f43d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	Q	F	T	Q	N	T	A	M	P	S	S	L	W	Q	Y	W	R	G	L	S	G	W	N	F	Y	F	L	V	K	F	G	L	L	W	A	G	Y	L	N	F	H	P	L	L	N	L	V	F	A	A	F	L	L	M	P	L	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	S	L	H	R	L	R	H	W	I	A	L	P	I	G	F	A	L	F	W	H	D	T	W	L	P	G	P	E	S	I	M	S	Q	G	S	Q	V	A	G	F	S	T	D	Y	L	I	D	L	V	T	R	F	I	N	W	Q	M	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	I	F	V	L	L	V	A	W	L	F	L	S	Q	W	I	R	I	T	V	F	V	V	A	I	L	L	W	L	N	V	L	T	L	A	G	P	S	F	S	L	W	P	A	G	Q	P	T	T	T	V	T	T	T	G	G	N	A	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	V	A	A	T	G	G	A	P	V	V	G	D	M	P	A	Q	T	A	P	P	T	T	A	N	L	N	A	W	L	N	N	F	Y	N	A	E	A	K	R	K	S	T	F	P	S	S	L	P	A	D	A	Q	P	F	E	L	L	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	I	C	S	L	S	W	S	D	I	E	A	A	G	L	M	S	H	P	L	W	S	H	F	D	I	E	F	K	N	F	N	S	A	T	S	Y	S	G	P	A	A	I	R	L	L	R	A	S	C	G	Q	T	S	H	T	N	L	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	A	N	N	D	C	Y	L	F	D	N	L	S	K	L	G	F	T	Q	H	L	M	M	G	H	N	G	Q	F	G	G	F	L	K	E	V	R	E	N	G	G	M	Q	S	E	L	M	D	Q	T	N	L	P	V	I	L	L	G	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?															?										?	?	?					?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	S	P	V	Y	D	D	T	A	V	L	N	R	W	L	D	V	T	E	K	D	K	N	S	R	S	A	T	F	Y	N	T	L	P	L	H	D	G	N	H	Y	P	G	V	S	K	T	A	D	Y	K	A	R	A	Q	K	F	F	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?															?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	D	A	F	F	T	E	L	E	K	S	G	R	K	V	M	V	V	V	V	P	E	H	G	G	A	L	K	G	D	R	M	Q	V	S	G	L	R	D	I	P	S	P	S	I	T	D	V	P	V	G	V	K	F	F	G	M	K	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?		?		?	?	?	?	?																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		H	Q	G	A	P	I	V	I	E	Q	P	S	S	F	L	A	I	S	D	L	V	V	R	V	L	D	G	K	I	F	T	E	D	N	V	D	W	K	K	L	T	S	G	L	P	Q	T	A	P	V	S	E	N	S	N	A	V	V	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	Q	D	K	P	Y	V	R	L	N	G	G	D	W	V	P	Y	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand