Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33349 Date Thu Jan 5 11:51:51 GMT 2012 Unique Job ID 8012b355dc6db436

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	P	L	I	V	G	I	R	H	H	S	P	A	C	A	R	L	V	K	S	L	I	E	S	Q	R	P	R	Y	V	L	I	E	G	P	A	D	F	N	D	R	V	D	E	L	F	L	A	H	Q	L	P	V	A	I	Y	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	Q	Y	Q	D	G	A	A	P	G	R	G	A	W	T	P	F	A	E	F	S	P	E	W	Q	A	L	Q	A	A	R	R	I	Q	A	Q	T	Y	F	I	D	L	P	C	W	A	Q	S	E	E	E	D	D	S	P	D	T	Q	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?			?																																					?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	Q	A	L	L	L	R	A	T	R	M	D	N	S	D	T	L	W	D	H	L	F	E	D	E	S	Q	Q	T	A	L	P	S	A	L	A	H	Y	F	A	Q	L	R	G	D	A	S	G	D	A	L	N	R	Q	R	E	A	F	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	W	I	G	W	A	M	Q	Q	N	N	G	D	V	L	V	V	C	G	G	W	H	A	P	A	L	A	K	M	W	R	E	C	P	Q	K	I	N	K	P	E	L	P	S	L	A	D	A	V	T	G	C	Y	L	T	P	Y	S	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	L	D	V	L	A	G	Y	L	S	G	M	P	A	P	V	W	Q	N	W	C	W	Q	W	G	L	Q	K	A	G	E	Q	L	L	K	T	I	L	T	R	L	R	Q	H	K	L	P	A	S	T	A	D	M	A	A	A	H	L	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?				?																																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	A	L	A	Q	L	R	G	H	T	L	P	L	R	T	D	W	L	D	A	I	A	G	S	L	I	K	E	A	L	N	A	P	L	P	W	S	Y	R	G	V	I	H	P	D	T	D	P	I	L	L	T	L	I	D	T	L	A	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	F	G	K	L	A	P	S	T	P	Q	P	P	L	P	K	D	V	T	C	E	L	E	R	T	A	I	S	L	P	A	E	L	T	L	N	R	F	T	P	D	G	L	A	Q	S	Q	V	L	H	R	L	A	I	L	E	I	P	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?																		?	?	?										?
Disorder confidence
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Sequence		V	R	Q	Q	G	S	T	L	T	L	A	G	N	G	E	E	R	W	K	L	T	R	P	L	S	Q	H	A	A	L	I	E	A	A	C	F	G	A	T	L	Q	E	A	A	R	N	K	L	E	A	D	M	L	D	A	G	G	I	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	T	T	C	L	S	Q	A	A	L	A	G	L	A	S	F	S	Q	Q	L	L	E	Q	L	T	L	L	I	A	Q	E	N	Q	F	A	E	M	G	Q	A	L	E	V	L	Y	A	L	W	R	L	D	E	I	S	G	M	Q	G	A	Q
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	L	Q	T	T	L	C	A	T	I	D	R	T	L	W	L	C	E	S	N	G	R	P	D	E	K	E	F	H	A	H	L	H	S	W	Q	A	L	C	H	I	L	R	D	L	H	S	G	V	N	L	P	G	V	S	L	S	A	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?		?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	L	L	E	R	R	S	Q	A	I	H	A	P	A	L	D	R	G	A	A	L	G	A	L	M	R	L	E	H	P	N	A	S	A	E	A	A	L	T	M	L	A	Q	L	S	P	A	Q	S	G	E	A	L	H	G	L	L	A	L	A
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		R	H	Q	L	A	C	Q	P	A	F	I	A	G	F	S	S	H	L	N	Q	L	S	E	A	D	F	I	N	A	L	P	D	L	R	A	A	M	A	W	L	P	P	R	E	R	G	T	L	A	H	Q	V	L	E	H	Y	Q	L	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																																																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	P	V	S	A	L	Q	M	P	L	H	C	P	P	Q	A	I	A	H	H	Q	Q	L	E	Q	Q	A	L	A	S	L	Q	N	W	G	V	F	H	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand