Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P27298 Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Unique Job ID 7fdef948df9a1764

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	N	P	L	L	T	P	F	E	L	P	P	F	S	K	I	L	P	E	H	V	V	P	A	V	T	K	A	L	N	D	C	R	E	N	V	E	R	V	V	A	Q	G	A	P	Y	T	W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L	P	L	L	S	E	Y	S	T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	N	T	A	Q	K	K	A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V	L	D	A	T	M	G	W	T	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L	E	G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A	G	K	W	D	N	S	K	V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M	A	E	N	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	E	L	Q	P	W	D	I	A	Y	Y	S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	A	V	N	G	L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S	F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K	R	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	W	M	D	D	C	V	G	Q	M	R	K	A	D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T	C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	I	E	T	A	G	V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A	V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W	C	W	E	P	E	A	L	A	F	I	S	G	H	Y	E	T	G	E	P	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	Y	Q	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	E	F	R	P	D	Q	G	A	K	I	L	E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	V	P	S	P	S	W	G	R	F	P	H	A	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	F	N	R	E	T	G	Q	S	F	L	D	N	I	L	S	R	G	G	S	E	E	P	M	D	L	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680
Sequence		R	F	R	G	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H	Y	G	I	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand