Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0C0L7 Date Thu Jan 5 11:29:54 GMT 2012 Unique Job ID 7f08eb684cdf07fd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	R	K	K	V	K	P	I	T	L	R	D	V	T	I	I	D	D	G	K	L	R	K	A	I	T	A	A	S	L	G	N	A	M	E	W	F	D	F	G	V	Y	G	F	V	A	Y	A	L	G	K	V	F	F	P	G	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	S	V	Q	M	V	A	A	L	A	T	F	S	V	P	F	L	I	R	P	L	G	G	L	F	F	G	M	L	G	D	K	Y	G	R	Q	K	I	L	A	I	T	I	V	I	M	S	I	S	T	F	C	I	G	L	I	P	S	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	I	G	I	W	A	P	I	L	L	L	I	C	K	M	A	Q	G	F	S	V	G	G	E	Y	T	G	A	S	I	F	V	A	E	Y	S	P	D	R	K	R	G	F	M	G	S	W	L	D	F	G	S	I	A	G	F	V	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	V	V	V	L	I	S	T	I	V	G	E	A	N	F	L	D	W	G	W	R	I	P	F	F	I	A	L	P	L	G	I	I	G	L	Y	L	R	H	A	L	E	E	T	P	A	F	Q	Q	H	V	D	K	L	E	Q	G	D	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	L	Q	D	G	P	K	V	S	F	K	E	I	A	T	K	Y	W	R	S	L	L	T	C	I	G	L	V	I	A	T	N	V	T	Y	Y	M	L	L	T	Y	M	P	S	Y	L	S	H	N	L	H	Y	S	E	D	H	G	V	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	I	A	I	M	I	G	M	L	F	V	Q	P	V	M	G	L	L	S	D	R	F	G	R	R	P	F	V	L	L	G	S	V	A	L	F	V	L	A	I	P	A	F	I	L	I	N	S	N	V	I	G	L	I	F	A	G	L	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	A	V	I	L	N	C	F	T	G	V	M	A	S	T	L	P	A	M	F	P	T	H	I	R	Y	S	A	L	A	A	A	F	N	I	S	V	L	V	A	G	L	T	P	T	L	A	A	W	L	V	E	S	S	Q	N	L	M	M	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	Y	Y	L	M	V	V	A	V	V	G	L	I	T	G	V	T	M	K	E	T	A	N	R	P	L	K	G	A	T	P	A	A	S	D	I	Q	E	A	K	E	I	L	V	E	H	Y	D	N	I	E	Q	K	I	D	D	I	D	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Sequence		I	A	D	L	Q	A	K	R	T	R	L	V	Q	Q	H	P	R	I	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand