Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75882 Date Thu Jan 5 12:15:23 GMT 2012 Unique Job ID 7de0b0c76cbba0bd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	N	S	Y	L	L	S	C	L	A	I	A	V	S	S	A	C	H	A	E	V	L	T	Y	P	D	P	L	G	S	S	Q	S	D	F	G	G	T	G	L	L	Q	M	P	N	A	R	I	A	P	E	G	E	F	S	V	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	D	N	D	Q	Y	R	F	Y	S	T	S	V	A	L	F	P	W	L	E	G	T	I	R	Y	T	D	V	R	T	R	K	Y	S	Q	W	E	D	F	S	G	D	Q	S	Y	K	D	K	S	F	D	F	K	L	R	L	W	E	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?		?	?					?	?	?	?		?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	W	L	P	Q	V	A	F	G	K	R	D	I	A	G	T	G	L	F	D	G	E	Y	L	V	A	S	K	Q	A	G	P	F	D	F	T	L	G	M	A	W	G	Y	A	G	N	A	G	N	I	T	N	P	F	C	R	V	S	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	C	H	R	A	E	S	H	D	A	G	D	I	S	F	S	D	I	F	R	G	P	A	S	I	F	G	G	I	E	Y	Q	T	P	W	N	P	L	R	L	K	L	E	Y	D	G	N	N	Y	Q	N	D	F	A	G	K	L	P	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?	?	?								?																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	H	F	N	V	G	A	V	Y	R	A	A	S	W	A	D	L	N	L	S	Y	E	R	G	N	T	L	M	F	G	F	T	L	R	T	N	F	N	D	L	R	P	A	L	R	D	T	P	K	P	A	Y	Q	P	A	P	E	S	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Q	Y	T	T	V	A	N	Q	L	T	A	L	K	Y	N	A	G	F	D	A	P	E	I	Q	L	R	D	K	T	L	Y	M	S	G	Q	Q	Y	K	Y	R	D	S	R	E	A	V	D	R	A	N	R	I	L	V	N	N	L	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?															?						?	?			?	?													?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	V	E	K	I	S	V	T	Q	K	R	E	H	M	A	M	V	T	T	E	T	D	V	A	S	L	R	K	Q	L	A	G	T	A	P	G	Q	S	E	P	L	Q	Q	Q	R	V	E	A	E	D	L	S	A	F	G	R	G	Y	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																														?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	E	D	R	F	S	Y	S	F	N	P	T	L	S	Q	S	L	G	G	P	E	D	F	Y	M	F	Q	L	G	L	M	S	S	A	R	Y	W	F	T	D	H	L	L	L	D	G	G	I	F	T	N	I	Y	N	N	Y	D	K	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																										?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	S	L	L	P	A	D	S	T	L	P	R	V	R	T	H	I	R	D	Y	V	R	N	D	V	Y	L	N	N	L	Q	A	N	Y	F	A	D	L	G	N	G	F	Y	G	Q	V	Y	G	G	Y	L	E	T	M	Y	A	G	V	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	L	L	Y	R	P	L	D	A	C	W	A	L	G	V	D	V	N	Y	V	K	Q	R	D	W	D	N	M	M	R	F	T	D	Y	S	T	P	T	G	F	V	T	A	Y	W	N	P	P	T	L	N	G	V	L	M	K	L	S	V	G
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	Y	L	A	K	D	K	G	A	T	I	D	V	A	K	R	F	D	S	G	V	A	V	G	V	W	A	A	I	S	N	V	S	K	D	D	Y	G	E	G	G	F	S	K	G	F	Y	I	S	I	P	F	D	L	M	T	I	G	P	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	N	R	A	V	V	S	W	T	P	L	T	R	D	G	G	Q	M	L	S	R	K	Y	Q	L	Y	P	M	T	A	E	R	E	V	P	V	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?															?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand