Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P27243 Date Thu Jan 5 11:43:23 GMT 2012 Unique Job ID 7d4d6de964902b7a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	T	S	F	K	L	H	S	L	K	P	Y	T	L	K	S	S	M	I	L	E	I	I	T	Y	I	L	C	F	F	S	M	I	I	A	F	V	D	N	T	F	S	I	K	I	Y	N	I	T	A	I	V	C	L	L	S	L	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	G	R	Q	E	N	Y	N	I	K	N	L	I	L	P	L	S	I	F	L	I	G	L	L	D	L	I	W	Y	S	A	F	K	V	D	N	S	P	F	R	A	T	Y	H	S	Y	L	N	T	A	K	I	F	I	F	G	S	F	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?		?	?	?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	L	T	L	T	S	Q	L	K	S	K	K	E	S	V	L	Y	T	L	Y	S	L	S	F	L	I	A	G	Y	A	M	Y	I	N	S	I	H	E	N	D	R	I	S	F	G	V	G	T	A	T	G	A	A	Y	S	T	M	L	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?		?																													?		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	V	S	G	V	A	I	L	Y	T	K	K	N	H	P	F	L	F	L	L	N	S	C	A	V	L	Y	V	L	A	L	T	Q	T	R	A	T	L	L	L	F	P	I	I	C	V	A	A	L	I	A	Y	Y	N	K	S	P	K	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?																																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	S	S	I	V	L	L	I	A	I	L	A	S	I	V	I	I	F	N	K	P	I	Q	N	R	Y	N	E	A	L	N	D	L	N	S	Y	T	N	A	N	S	V	T	S	L	G	A	R	L	A	M	Y	E	I	G	L	N	I	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	S	P	F	S	F	R	S	A	E	S	R	A	E	S	M	N	L	L	V	A	E	H	N	R	L	R	G	A	L	E	F	S	N	V	H	L	H	N	E	I	I	E	A	G	S	L	K	G	L	M	G	I	F	S	T	L	F	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?				?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	S	L	F	Y	I	A	Y	K	K	R	A	L	G	L	L	I	L	T	L	G	I	V	G	I	G	L	S	D	V	I	I	W	A	R	S	I	P	I	I	I	I	S	A	I	V	L	L	L	V	I	N	N	R	N	N	T	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand