Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFZ7 Date Thu Jan 5 11:27:41 GMT 2012 Unique Job ID 7cfa549415c04356

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	F	R	A	I	T	R	I	V	G	L	L	V	I	L	F	S	G	T	M	I	I	P	G	L	V	A	L	I	Y	R	D	G	A	G	R	A	F	T	Q	T	F	F	V	A	L	A	I	G	S	M	L	W	W	P	N	R	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																						?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	G	E	L	K	S	R	E	G	F	L	I	V	V	L	F	W	T	V	L	G	S	V	G	A	L	P	F	I	F	S	E	S	P	N	L	T	I	T	D	A	F	F	E	S	F	S	G	L	T	T	T	G	A	T	T	L	V	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	S	L	P	H	A	I	L	F	Y	R	Q	M	L	Q	W	F	G	G	M	G	I	I	V	L	A	V	A	I	L	P	I	L	G	V	G	G	M	Q	L	Y	R	A	E	M	P	G	P	L	K	D	N	K	M	R	P	R	I	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	K	T	L	W	L	I	Y	V	L	L	T	V	A	C	A	L	A	L	W	F	A	G	M	D	A	F	D	A	I	G	H	S	F	A	T	I	A	I	G	G	F	S	T	H	D	A	S	I	G	Y	F	D	S	P	T	I	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	I	A	I	F	L	L	I	S	G	C	N	Y	G	L	H	F	S	L	L	S	G	R	S	L	K	V	Y	W	R	D	P	E	F	R	M	F	I	G	V	Q	F	T	L	V	V	I	C	T	L	V	L	W	F	H	N	V	Y	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	L	M	T	I	N	Q	A	F	F	Q	V	V	S	M	A	T	T	A	G	F	T	T	D	S	I	A	R	W	P	L	F	L	P	V	L	L	L	C	S	A	F	I	G	G	C	A	G	S	T	G	G	G	L	K	V	I	R	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	L	F	K	Q	G	N	R	E	L	K	R	L	V	H	P	N	A	V	Y	S	I	K	L	G	N	R	A	L	P	E	R	I	L	E	A	V	W	G	F	F	S	A	Y	A	L	V	F	I	V	S	M	L	A	I	I	A	T	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?		?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	D	F	S	A	F	A	S	V	V	A	T	L	N	N	L	G	P	G	L	G	V	V	A	D	N	F	T	S	M	N	P	V	A	K	W	I	L	I	A	N	M	L	F	G	R	L	E	V	F	T	L	L	V	L	F	T	P	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?		?	?																													?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		W	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand