Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46817 Date Thu Jan 5 12:34:42 GMT 2012 Unique Job ID 7cad0c107f312f1a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	D	I	L	Q	T	P	D	A	P	K	P	Q	G	A	L	D	N	Y	F	K	I	T	A	R	G	S	T	V	R	Q	E	V	L	A	G	L	T	T	F	L	A	M	V	Y	S	V	I	V	V	P	G	M	L	G	K	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	P	P	A	A	V	F	V	A	T	C	L	V	A	G	F	G	S	L	L	M	G	L	W	A	N	L	P	M	A	I	G	C	A	I	S	L	T	A	F	T	A	F	S	L	V	L	G	Q	Q	I	S	V	P	V	A	L	G	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																							?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	L	M	G	V	I	F	T	A	I	S	V	T	G	V	R	T	W	I	L	R	N	L	P	M	G	I	A	H	G	T	G	I	G	I	G	L	F	L	L	L	I	A	A	N	G	V	G	M	V	I	K	N	P	I	E	G	L	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	L	G	A	F	T	S	F	P	V	M	M	S	L	L	G	L	A	V	I	F	G	L	E	K	C	R	V	P	G	G	I	L	L	V	I	I	A	I	S	I	I	G	L	I	F	D	P	A	V	K	Y	H	G	L	V	A	M	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?		?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	T	G	E	D	G	K	S	L	I	F	S	L	D	I	M	G	A	L	Q	P	T	V	L	P	S	V	L	A	L	V	M	T	A	V	F	D	A	T	G	T	I	R	A	V	A	G	Q	A	N	L	L	D	K	D	N	Q	I	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?			?																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	G	K	A	L	T	S	D	S	V	S	S	I	F	S	G	L	V	G	A	A	P	A	A	V	Y	I	E	S	A	A	G	T	A	A	G	G	K	T	G	L	T	A	T	V	V	G	A	L	F	L	L	I	L	F	L	S	P	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																	?	?	?			?					?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	I	P	G	Y	A	T	A	P	A	L	M	Y	V	G	L	L	M	L	S	N	V	S	K	L	D	F	N	D	F	I	D	A	M	A	G	L	V	C	A	V	F	I	V	L	T	C	N	I	V	T	G	I	M	L	G	F	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Sequence		L	V	V	G	R	V	F	A	R	E	W	Q	K	L	N	I	G	T	V	I	I	T	A	A	L	V	A	F	Y	A	G	G	W	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand