Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07001 Date Thu Jan 5 10:59:54 GMT 2012 Unique Job ID 7be744fab2653baa

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	I	G	I	P	R	E	R	L	T	N	E	T	R	V	A	A	T	P	K	T	V	E	Q	L	L	K	L	G	F	T	V	A	V	E	S	G	A	G	Q	L	A	S	F	D	D	K	A	F	V	Q	A	G	A	E	I	V	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?	?																																	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	S	V	W	Q	S	E	I	I	L	K	V	N	A	P	L	D	D	E	I	A	L	L	N	P	G	T	T	L	V	S	F	I	W	P	A	Q	N	P	E	L	M	Q	K	L	A	E	R	N	V	T	V	M	A	M	D	S	V	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	S	R	A	Q	S	L	D	A	L	S	S	M	A	N	I	A	G	Y	R	A	I	V	E	A	A	H	E	F	G	R	F	F	T	G	Q	I	T	A	A	G	K	V	P	P	A	K	V	M	V	I	G	A	G	V	A	G	L	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	G	A	A	N	S	L	G	A	I	V	R	A	F	D	T	R	P	E	V	K	E	Q	V	Q	S	M	G	A	E	F	L	E	L	D	F	K	E	E	A	G	S	G	D	G	Y	A	K	V	M	S	D	A	F	I	K	A	E	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?	?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	F	A	A	Q	A	K	E	V	D	I	I	V	T	T	A	L	I	P	G	K	P	A	P	K	L	I	T	R	E	M	V	D	S	M	K	A	G	S	V	I	V	D	L	A	A	Q	N	G	G	N	C	E	Y	T	V	P	G	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	T	T	E	N	G	V	K	V	I	G	Y	T	D	L	P	G	R	L	P	T	Q	S	S	Q	L	Y	G	T	N	L	V	N	L	L	K	L	L	C	K	E	K	D	G	N	I	T	V	D	F	D	D	V	V	I	R	G	V	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	R	A	G	E	I	T	W	P	A	P	P	I	Q	V	S	A	Q	P	Q	A	A	Q	K	A	A	P	E	V	K	T	E	E	K	C	T	C	S	P	W	R	K	Y	A	L	M	A	L	A	I	I	L	F	G	W	M	A	S	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	K	E	F	L	G	H	F	T	V	F	A	L	A	C	V	V	G	Y	Y	V	V	W	N	V	S	H	A	L	H	T	P	L	M	S	V	T	N	A	I	S	G	I	I	V	V	G	A	L	L	Q	I	G	Q	G	G	W	V	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Sequence		L	S	F	I	A	V	L	I	A	S	I	N	I	F	G	G	F	T	V	T	Q	R	M	L	K	M	F	R	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand