Phyre 2 Results for P0AFL1

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P0AFL1
Date	Wed Jan 25 15:20:33 GMT 2012
Unique Job ID	7a89500a58ee6b0d

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M N N L P V V R S P W R I V I L L L G F T F L Y A P M L M L V I Y S F N S S K L V T V W A G W S T R W Y G E L L R D D A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence M M S A V G L S L T I A A C A A T A A A I L G T I A A V V L V R F G R F R G S N G F A F M I T A P L V M P D V I T G L S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence L L L L F V A L A H A I G W P A D R G M L T I W L A H V T F C T A Y V A V V I S S R L R E L D R S I E E A A M D L G A T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence P L K V F F V I T L P M I M P A I I S G W L L A F T L S L D D L V I A S F V S G P G A T T L P M L V F S S V R M G V N P

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 .

Sequence E I N A L A T L I L G A V G I V G F I A W Y L M A R A E K Q R I R D I Q R A R R G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand

	1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence	M	N	N	L	P	V	V	R	S	P	W	R	I	V	I	L	L	L	G	F	T	F	L	Y	A	P	M	L	M	L	V	I	Y	S	F	N	S	S	K	L	V	T	V	W	A	G	W	S	T	R	W	Y	G	E	L	L	R	D	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence	M	M	S	A	V	G	L	S	L	T	I	A	A	C	A	A	T	A	A	A	I	L	G	T	I	A	A	V	V	L	V	R	F	G	R	F	R	G	S	N	G	F	A	F	M	I	T	A	P	L	V	M	P	D	V	I	T	G	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence	L	L	L	L	F	V	A	L	A	H	A	I	G	W	P	A	D	R	G	M	L	T	I	W	L	A	H	V	T	F	C	T	A	Y	V	A	V	V	I	S	S	R	L	R	E	L	D	R	S	I	E	E	A	A	M	D	L	G	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence	P	L	K	V	F	F	V	I	T	L	P	M	I	M	P	A	I	I	S	G	W	L	L	A	F	T	L	S	L	D	D	L	V	I	A	S	F	V	S	G	P	G	A	T	T	L	P	M	L	V	F	S	S	V	R	M	G	V	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?												?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Sequence	E	I	N	A	L	A	T	L	I	L	G	A	V	G	I	V	G	F	I	A	W	Y	L	M	A	R	A	E	K	Q	R	I	R	D	I	Q	R	A	R	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence