Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07118 Date Thu Jan 5 11:00:14 GMT 2012 Unique Job ID 787975fc6fffba03

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	K	T	Y	N	P	Q	D	I	E	Q	P	L	Y	E	H	W	E	K	Q	G	Y	F	K	P	N	G	D	E	S	Q	E	S	F	C	I	M	I	P	P	P	N	V	T	G	S	L	H	M	G	H	A	F	Q	Q	T	I	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	M	I	R	Y	Q	R	M	Q	G	K	N	T	L	W	Q	V	G	T	D	H	A	G	I	A	T	Q	M	V	V	E	R	K	I	A	A	E	E	G	K	T	R	H	D	Y	G	R	E	A	F	I	D	K	I	W	E	W	K	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	G	G	T	I	T	R	Q	M	R	R	L	G	N	S	V	D	W	E	R	E	R	F	T	M	D	E	G	L	S	N	A	V	K	E	V	F	V	R	L	Y	K	E	D	L	I	Y	R	G	K	R	L	V	N	W	D	P	K	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	I	S	D	L	E	V	E	N	R	E	S	K	G	S	M	W	H	I	R	Y	P	L	A	D	G	A	K	T	A	D	G	K	D	Y	L	V	V	A	T	T	R	P	E	T	L	L	G	D	T	G	V	A	V	N	P	E	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?			?	?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	Y	K	D	L	I	G	K	Y	V	I	L	P	L	V	N	R	R	I	P	I	V	G	D	E	H	A	D	M	E	K	G	T	G	C	V	K	I	T	P	A	H	D	F	N	D	Y	E	V	G	K	R	H	A	L	P	M	I	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	T	F	D	G	D	I	R	E	S	A	Q	V	F	D	T	K	G	N	E	S	D	V	Y	S	S	E	I	P	A	E	F	Q	K	L	E	R	F	A	A	R	K	A	V	V	A	A	V	D	A	L	G	L	L	E	E	I	K	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	L	T	V	P	Y	G	D	R	G	G	V	V	I	E	P	M	L	T	D	Q	W	Y	V	R	A	D	V	L	A	K	P	A	V	E	A	V	E	N	G	D	I	Q	F	V	P	K	Q	Y	E	N	M	Y	F	S	W	M	R	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	D	W	C	I	S	R	Q	L	W	W	G	H	R	I	P	A	W	Y	D	E	A	G	N	V	Y	V	G	R	N	E	D	E	V	R	K	E	N	N	L	G	A	D	V	V	L	R	Q	D	E	D	V	L	D	T	W	F	S	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	W	T	F	S	T	L	G	W	P	E	N	T	D	A	L	R	Q	F	H	P	T	S	V	M	V	S	G	F	D	I	I	F	F	W	I	A	R	M	I	M	M	T	M	H	F	I	K	D	E	N	G	K	P	Q	V	P	F	H	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	Y	M	T	G	L	I	R	D	D	E	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	V	I	D	P	L	D	M	V	D	G	I	S	L	P	E	L	L	E	K	R	T	G	N	M	M	Q	P	Q	L	A	D	K	I	R	K	R	T	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	F	P	N	G	I	E	P	H	G	T	D	A	L	R	F	T	L	A	A	L	A	S	T	G	R	D	I	N	W	D	M	K	R	L	E	G	Y	R	N	F	C	N	K	L	W	N	A	S	R	F	V	L	M	N	T	E	G	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		C	G	F	N	G	G	E	M	T	L	S	L	A	D	R	W	I	L	A	E	F	N	Q	T	I	K	A	Y	R	E	A	L	D	S	F	R	F	D	I	A	A	G	I	L	Y	E	F	T	W	N	Q	F	C	D	W	Y	L	E	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		K	P	V	M	N	G	G	T	E	A	E	L	R	G	T	R	H	T	L	V	T	V	L	E	G	L	L	R	L	A	H	P	I	I	P	F	I	T	E	T	I	W	Q	R	V	K	V	L	C	G	I	T	A	D	T	I	M	L	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		F	P	Q	Y	D	A	S	Q	V	D	E	A	A	L	A	D	T	E	W	L	K	Q	A	I	V	A	V	R	N	I	R	A	E	M	N	I	A	P	G	K	P	L	E	L	L	L	R	G	C	S	A	D	A	E	R	R	V	N	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		R	G	F	L	Q	T	L	A	R	L	E	S	I	T	V	L	P	A	D	D	K	G	P	V	S	V	T	K	I	I	D	G	A	E	L	L	I	P	M	A	G	L	I	N	K	E	D	E	L	A	R	L	A	K	E	V	A	K	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.
Sequence		G	E	I	S	R	I	E	N	K	L	A	N	E	G	F	V	A	R	A	P	E	A	V	I	A	K	E	R	E	K	L	E	G	Y	A	E	A	K	A	K	L	I	E	Q	Q	A	V	I	A	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?																																			?	?	?
Disorder confidence