Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75783 Date Thu Jan 5 12:14:05 GMT 2012 Unique Job ID 785c43833a7cfdad

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	W	I	L	F	I	L	F	C	L	L	G	A	P	A	H	A	V	S	I	P	G	V	T	T	T	T	T	T	D	S	T	T	E	P	A	P	E	P	D	I	E	Q	K	K	A	A	Y	G	A	L	A	D	V	L	D	N	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?
Disorder confidence
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Sequence		S	R	K	E	L	I	D	Q	L	R	T	V	A	A	T	P	P	A	E	P	V	P	K	I	V	P	P	T	L	V	E	E	Q	T	V	L	Q	K	V	T	E	V	S	R	H	Y	G	E	A	L	S	A	R	F	G	Q	L	Y	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	T	G	S	P	H	K	P	F	N	P	Q	T	F	S	N	A	L	T	H	F	S	M	L	A	V	L	V	F	G	F	Y	W	L	I	R	L	C	A	L	P	L	Y	R	K	M	G	Q	W	A	R	Q	K	N	R	E	R	S	N	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	Q	L	P	A	M	I	I	G	A	F	I	I	D	L	L	L	L	A	L	T	L	F	V	G	Q	V	L	S	D	N	L	N	A	G	S	R	T	I	A	F	Q	Q	S	L	F	L	N	A	F	A	L	I	E	F	F	K	A	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?		?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	L	I	F	C	P	N	V	A	E	L	R	P	F	T	I	Q	D	E	S	A	R	Y	W	S	R	R	L	S	W	L	S	S	L	I	G	Y	G	L	I	V	A	V	P	I	I	S	N	Q	V	N	V	Q	I	G	A	L	A	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	I	M	L	C	M	T	V	W	A	L	Y	L	I	F	R	N	K	K	E	I	T	Q	H	L	L	N	F	A	E	H	S	L	A	F	F	S	L	F	I	R	A	F	A	L	V	W	H	W	L	A	S	A	Y	F	I	V	L	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	S	L	F	D	P	G	N	S	L	K	F	M	M	G	A	T	V	R	S	L	A	I	I	G	I	A	A	F	V	S	G	M	F	S	R	W	L	A	K	T	I	T	L	S	P	H	T	Q	R	N	Y	P	E	L	Q	K	R	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?		?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	W	L	S	A	A	L	K	T	A	R	I	L	T	V	C	V	A	V	M	L	L	L	S	A	W	G	L	F	D	F	W	N	W	L	Q	N	G	A	G	Q	K	T	V	D	I	L	I	R	I	A	L	I	L	F	F	S	A	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		W	T	V	L	A	S	L	I	E	N	R	L	A	S	D	I	H	G	R	P	L	P	S	A	R	T	R	T	L	L	T	L	F	R	N	A	L	A	V	I	I	S	T	I	T	I	M	I	V	L	S	E	I	G	V	N	I	A	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?		?																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	A	G	A	G	A	L	G	L	A	I	S	F	G	S	Q	T	L	V	K	D	I	I	T	G	V	F	I	Q	F	E	N	G	M	N	T	G	D	L	V	T	I	G	P	L	T	G	T	V	E	R	M	S	I	R	S	V	G	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	D	T	G	A	Y	H	I	I	P	W	S	S	I	T	T	F	A	N	F	V	R	G	I	G	S	V	V	A	N	Y	D	V	D	R	H	E	D	A	D	K	A	N	Q	A	L	K	D	A	V	A	E	L	M	E	N	E	E	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	L	I	I	G	E	P	N	F	A	G	I	V	G	L	S	N	T	A	F	T	L	R	V	S	F	T	T	L	P	L	K	Q	W	T	V	R	F	A	L	D	S	Q	V	K	K	H	F	D	L	A	G	V	R	A	P	V	Q	T	Y
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
Sequence		Q	V	L	P	A	P	G	A	T	P	A	E	P	L	P	P	G	E	P	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand