Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P29013 Date Thu Jan 5 11:45:33 GMT 2012 Unique Job ID 77ac6a0f30444808

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	I	D	S	M	N	K	D	T	T	R	L	S	D	G	P	D	W	T	F	D	L	L	D	V	Y	L	A	E	I	D	R	V	A	K	L	Y	R	L	D	T	Y	P	H	Q	I	E	V	I	T	S	E	Q	M	M	D	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	S	V	G	M	P	I	N	Y	P	H	W	S	F	G	K	K	F	I	E	T	E	R	L	Y	K	H	G	Q	Q	G	L	A	Y	E	I	V	I	N	S	N	P	C	I	A	Y	L	M	E	E	N	T	I	T	M	Q	A	L	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	H	A	C	Y	G	H	N	S	F	F	K	N	N	Y	L	F	R	S	W	T	D	A	S	S	I	V	D	Y	L	I	F	A	R	K	Y	I	T	E	C	E	E	R	Y	G	V	D	E	V	E	R	L	L	D	S	C	H	A	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	Y	G	V	D	R	Y	K	R	P	Q	K	I	S	L	Q	E	E	K	A	R	Q	K	S	R	E	E	Y	L	Q	S	Q	V	N	M	L	W	R	T	L	P	K	R	E	E	E	K	T	V	A	E	A	R	R	Y	P	S	E	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	N	L	L	Y	F	M	E	K	N	A	P	L	L	E	S	W	Q	R	E	I	L	R	I	V	R	K	V	S	Q	Y	F	Y	P	Q	K	Q	T	Q	V	M	N	E	G	W	A	T	F	W	H	Y	T	I	L	N	H	L	Y	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	K	V	T	E	R	F	M	L	E	F	L	H	S	H	T	N	V	V	F	Q	P	P	Y	N	S	P	W	Y	S	G	I	N	P	Y	A	L	G	F	A	M	F	Q	D	I	K	R	I	C	Q	S	P	T	E	E	D	K	Y	W	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																	?			?	?	?	?	?	?	?																					?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	D	I	A	G	S	D	W	L	E	T	L	H	F	A	M	R	D	F	K	D	E	S	F	I	S	Q	F	L	S	P	K	V	M	R	D	F	R	F	F	T	V	L	D	D	D	R	H	N	Y	L	E	I	S	A	I	H	N	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?																																								?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	Y	R	E	I	R	N	R	L	S	S	Q	Y	N	L	S	N	L	E	P	N	I	Q	I	W	N	V	D	L	R	G	D	R	S	L	T	L	R	Y	I	P	H	N	R	A	P	L	D	R	G	R	K	E	V	L	K	H	V	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Sequence		L	W	G	F	D	V	M	L	E	Q	Q	N	E	D	G	S	I	E	L	L	E	R	C	P	P	R	M	G	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?		?	?								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand