Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31826 Date Thu Jan 5 11:48:49 GMT 2012 Unique Job ID 7797db634451712f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	T	I	P	I	T	L	R	M	L	I	A	K	Y	L	C	L	L	K	P	F	W	L	R	K	N	N	K	T	S	V	L	L	I	I	I	I	L	A	M	I	L	G	V	V	K	I	Q	V	W	L	N	D	W	N	N	D	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	A	L	S	Q	K	E	T	D	K	L	W	Q	L	V	L	W	F	P	A	L	L	G	I	F	V	L	I	S	V	N	K	T	W	L	I	K	L	L	T	I	R	W	R	E	W	L	T	D	Y	Y	L	N	R	W	F	A	D	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	Y	F	T	Q	I	Y	G	E	H	K	N	T	D	N	P	D	Q	R	I	A	E	D	I	L	L	L	I	S	K	T	L	S	L	S	F	G	F	I	Q	S	L	S	M	L	I	T	F	T	V	I	L	W	E	S	A	G	T	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	T	V	G	G	T	E	W	N	I	Q	G	Y	M	V	Y	T	V	V	L	I	V	I	G	G	T	L	F	T	H	K	V	G	K	R	I	R	P	L	N	V	E	K	Q	R	S	E	A	T	F	R	T	N	L	V	Q	H	N	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	E	L	I	A	L	S	N	A	E	S	L	Q	R	Q	E	L	S	D	N	F	H	T	I	K	E	N	W	H	R	L	M	N	R	Q	R	W	L	D	Y	W	Q	N	I	Y	S	R	S	L	S	V	L	P	Y	F	L	L	L	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	I	S	G	Q	I	N	L	G	G	L	M	K	S	R	Q	A	F	M	L	V	S	N	N	L	S	W	F	I	Y	K	Y	D	E	L	A	E	L	A	A	V	I	D	R	L	Y	E	F	H	Q	L	T	E	Q	R	P	T	N	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	N	C	Q	H	A	V	Q	V	A	D	A	S	I	R	T	P	D	N	K	I	I	L	E	N	L	N	F	H	V	S	P	G	K	W	L	L	L	K	G	Y	S	G	A	G	K	T	T	L	L	K	T	L	S	H	C	W	P	W	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	G	D	I	S	S	P	A	D	S	W	Y	V	S	Q	T	P	L	I	K	T	G	L	L	K	E	I	I	C	K	A	L	P	L	P	V	D	D	K	S	L	S	E	V	L	H	Q	V	G	L	G	K	L	A	A	R	I	H	D	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	R	W	G	D	I	L	S	S	G	E	K	Q	R	I	A	L	A	R	L	I	L	R	R	P	K	W	I	F	L	D	E	T	T	S	H	L	E	E	Q	E	A	I	R	L	L	R	L	V	R	E	K	L	P	T	S	G	V	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Sequence		V	T	H	Q	P	G	V	W	N	L	A	D	D	I	C	D	I	S	A	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand