Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75937 Date Thu Jan 5 12:16:11 GMT 2012 Unique Job ID 773d2a189a9a63ff

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	F	S	Q	A	V	S	G	L	N	A	A	A	T	N	L	D	V	I	G	N	N	I	A	N	S	A	T	Y	G	F	K	S	G	T	A	S	F	A	D	M	F	A	G	S	K	V	G	L	G	V	K	V	A	G	I	T	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?															?	?															?	?	?				?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	T	D	G	T	T	T	N	T	G	R	G	L	D	V	A	I	S	Q	N	G	F	F	R	L	V	D	S	N	G	S	V	F	Y	S	R	N	G	Q	F	K	L	D	E	N	R	N	L	V	N	M	Q	G	L	Q	L	T	G	Y	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	T	G	T	P	P	T	I	Q	Q	G	A	N	P	T	N	I	S	I	P	N	T	L	M	A	A	K	T	T	T	T	A	S	M	Q	I	N	L	N	S	S	D	P	L	P	T	V	T	P	F	S	A	S	N	A	D	S	Y	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	G	S	V	T	V	F	D	S	Q	G	N	A	H	D	M	S	V	Y	F	V	K	T	G	D	N	N	W	Q	V	Y	T	Q	D	S	S	D	P	N	S	I	A	K	T	A	T	T	L	E	F	N	A	N	G	T	L	V	D	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?	?		?	?																										?		?	?	?	?	?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	N	N	I	A	T	G	A	I	N	G	A	E	P	A	T	F	S	L	S	F	L	N	S	M	Q	Q	N	T	G	A	N	N	I	V	A	T	T	Q	N	G	Y	K	P	G	D	L	V	S	Y	Q	I	N	D	D	G	T	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?				?	?			?		?									?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	N	Y	S	N	E	Q	T	Q	L	L	G	Q	I	V	L	A	N	F	A	N	N	E	G	L	A	S	E	G	D	N	V	W	S	A	T	Q	S	S	G	V	A	L	L	G	T	A	G	T	G	N	F	G	T	L	T	N	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?			?					?	?				?	?	?				?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Sequence		E	A	S	N	V	D	L	S	K	E	L	V	N	M	I	V	A	Q	R	N	Y	Q	S	N	A	Q	T	I	K	T	Q	D	Q	I	L	N	T	L	V	N	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand