Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16431 Date Thu Jan 5 11:35:07 GMT 2012 Unique Job ID 76f7568ef9e90403

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	E	K	L	G	Q	H	Y	L	A	A	L	N	E	A	F	P	G	V	V	L	D	H	A	W	Q	T	K	D	Q	L	T	V	T	V	K	V	N	Y	L	P	E	V	V	E	F	L	Y	Y	K	Q	G	G	W	L	S	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	G	N	D	E	R	K	L	N	G	H	Y	A	V	Y	Y	V	L	S	M	E	K	G	T	K	C	W	I	T	V	R	V	E	V	D	A	N	K	P	E	Y	P	S	V	T	P	R	V	P	A	A	V	W	G	E	R	E	V	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	Y	G	L	I	P	V	G	L	P	D	E	R	R	L	V	L	P	D	D	W	P	D	E	L	Y	P	L	R	K	D	S	M	D	Y	R	Q	R	P	A	P	T	T	D	A	E	T	Y	E	F	I	N	E	L	G	D	K	K	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?		?	?										?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	P	I	G	P	L	H	V	T	S	D	E	P	G	H	F	R	L	F	V	D	G	E	N	I	I	D	A	D	Y	R	L	F	Y	V	H	R	G	M	E	K	L	A	E	T	R	M	G	Y	N	E	V	T	F	L	S	D	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	G	I	C	G	F	A	H	S	T	A	Y	T	T	S	V	E	N	A	M	G	I	Q	V	P	E	R	A	Q	M	I	R	A	I	L	L	E	V	E	R	L	H	S	H	L	L	N	L	G	L	A	C	H	F	T	G	F	D	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	M	Q	F	F	R	V	R	E	T	S	M	K	M	A	E	I	L	T	G	A	R	K	T	Y	G	L	N	L	I	G	G	I	R	R	D	L	L	K	D	D	M	I	Q	T	R	Q	L	A	Q	Q	M	R	R	E	V	Q	E	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	V	L	L	S	T	P	N	M	E	Q	R	T	V	G	I	G	R	L	D	P	E	I	A	R	D	F	S	N	V	G	P	M	V	R	A	S	G	H	A	R	D	T	R	A	D	H	P	F	V	G	Y	G	L	L	P	M	E	V	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	E	Q	G	C	D	V	I	S	R	L	K	V	R	I	N	E	V	Y	T	A	L	N	M	I	D	Y	G	L	D	N	L	P	G	G	P	L	M	V	E	G	F	T	Y	I	P	H	R	F	A	L	G	F	A	E	A	P	R	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	I	H	W	S	M	T	G	D	N	Q	K	L	Y	R	W	R	C	R	A	A	T	Y	A	N	W	P	T	L	R	Y	M	L	R	G	N	T	V	S	D	A	P	L	I	I	G	S	L	D	P	C	Y	S	C	T	D	R	M	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	D	V	R	K	K	K	S	K	V	V	P	Y	K	E	L	E	R	Y	S	I	E	R	K	N	S	P	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?												?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand