Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36659 Date Thu Jan 5 11:53:32 GMT 2012 Unique Job ID 763943fcd0737153

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	L	K	D	Y	Y	A	I	M	G	V	K	P	T	D	D	L	K	T	I	K	T	A	Y	R	R	L	A	R	K	Y	H	P	D	V	S	K	E	P	D	A	E	A	R	F	K	E	V	A	E	A	W	E	V	L	S	D	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	R	A	E	Y	D	Q	M	W	Q	H	R	N	D	P	Q	F	N	R	Q	F	H	H	G	D	G	Q	S	F	N	A	E	D	F	D	D	I	F	S	S	I	F	G	Q	H	A	R	Q	S	R	Q	R	P	A	T	R	G	H	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	I	E	V	A	V	F	L	E	E	T	L	T	E	H	K	R	T	I	S	Y	N	L	P	V	Y	N	A	F	G	M	I	E	Q	E	I	P	K	T	L	N	V	K	I	P	A	G	V	G	N	G	Q	R	I	R	L	K	G	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	P	G	E	N	G	G	P	N	G	D	L	W	L	V	I	H	I	A	P	H	P	L	F	D	I	V	G	Q	D	L	E	I	V	V	P	V	S	P	W	E	A	A	L	G	A	K	V	T	V	P	T	L	K	E	S	I	L	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	P	P	G	S	Q	A	G	Q	R	L	R	V	K	G	K	G	L	V	S	K	K	Q	T	G	D	L	Y	A	V	L	K	I	V	M	P	P	K	P	D	E	N	T	A	A	L	W	Q	Q	L	A	D	A	Q	S	S	F	D	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		K	D	W	G	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand