Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37627 Date Wed Jan 25 15:20:52 GMT 2012 Unique Job ID 754e7a3b09ca1d1c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	I	G	T	V	A	G	T	N	D	S	T	T	T	I	A	T	N	D	M	V	Q	E	H	V	T	N	F	T	K	E	L	F	G	Y	I	A	N	G	I	G	D	D	I	S	S	I	A	R	T	M	L	G	E	V	V	E	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?			?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	D	W	Q	I	E	R	F	Q	Q	S	I	Q	D	D	K	I	S	F	T	I	Q	T	D	H	S	E	K	Y	S	M	L	S	G	M	R	A	H	I	L	R	R	N	N	N	Y	Q	F	I	V	T	I	N	S	K	N	Y	G	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	D	N	T	D	I	N	W	C	S	I	V	Y	L	L	N	N	M	T	V	N	D	N	A	N	D	V	A	V	T	E	S	Y	K	P	I	W	N	W	K	I	S	Q	Y	N	V	S	D	I	K	F	E	T	M	I	K	P	Q	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	R	I	Y	F	S	N	C	L	P	V	D	P	T	S	T	R	P	T	Y	F	G	D	T	D	G	S	V	G	A	V	L	F	A	L	F	A	T	G	H	L	G	I	M	A	E	G	E	N	F	L	S	Q	L	L	N	I	E	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	L	N	V	L	L	R	E	N	F	N	E	Q	L	N	T	N	V	N	T	I	I	S	I	L	N	R	R	D	I	I	L	E	S	L	Q	P	Y	L	V	I	N	K	D	A	V	T	P	C	T	F	L	G	D	Q	T	G	D	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	N	I	C	G	D	Q	F	I	I	D	L	L	K	R	I	M	S	I	N	E	N	V	H	V	L	A	G	N	H	E	T	N	C	N	G	N	Y	M	Q	N	F	T	R	M	K	P	L	D	E	D	T	Y	S	G	I	K	D	Y	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	C	F	Y	D	P	K	Y	K	I	M	A	N	H	H	G	I	T	F	D	D	Q	R	K	R	Y	I	I	G	P	I	T	V	S	I	D	E	M	T	N	A	L	D	P	V	E	L	A	A	I	I	N	K	K	H	H	A	I	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	K	K	F	K	T	S	R	A	I	S	C	R	S	F	N	R	Y	F	S	V	S	T	D	Y	R	P	K	L	E	A	L	L	A	C	S	Q	M	L	G	I	N	Q	V	V	A	H	N	G	N	G	G	R	E	R	I	G	E	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																												?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	V	L	G	L	N	A	R	D	S	K	H	A	G	R	M	F	S	M	H	N	C	Q	I	N	P	G	A	G	P	E	I	T	T	P	W	K	S	Y	Q	H	E	K	N	R	N	G	L	M	P	L	I	R	R	R	T	M	L	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?			?	?									?					?											?	?	?	?	?	?	?		?							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
Sequence
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand