Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFK0 Date Thu Jan 5 11:26:33 GMT 2012 Unique Job ID 74ac3b25541de69b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	L	A	M	K	V	I	S	Q	V	E	A	Q	R	K	I	L	E	E	A	V	S	T	A	L	E	L	A	S	G	K	S	D	G	A	E	V	A	V	S	K	T	T	G	I	S	V	S	T	R	Y	G	E	V	E	N	V	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																																	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	S	D	G	A	L	G	I	T	V	Y	H	Q	N	R	K	G	S	A	S	S	T	D	L	S	P	Q	A	I	A	R	T	V	Q	A	A	L	D	I	A	R	Y	T	S	P	D	P	C	A	G	V	A	D	K	E	L	L	A	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																						?	?			?		?	?							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	P	D	L	D	L	F	H	P	A	E	V	S	P	D	E	A	I	E	L	A	A	R	A	E	Q	A	A	L	Q	A	D	K	R	I	T	N	T	E	G	G	S	F	N	S	H	Y	G	V	K	V	F	G	N	S	H	G	M	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	Y	C	S	T	R	H	S	L	S	S	C	V	I	A	E	E	N	G	D	M	E	R	D	Y	A	Y	T	I	G	R	A	M	S	D	L	Q	T	P	E	W	V	G	A	D	C	A	R	R	T	L	S	R	L	S	P	R	K	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	M	K	A	P	V	I	F	A	N	E	V	A	T	G	L	F	G	H	L	V	G	A	I	A	G	G	S	V	Y	R	K	S	T	F	L	L	D	S	L	G	K	Q	I	L	P	D	W	L	T	I	E	E	H	P	H	L	L	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	S	T	P	F	D	S	E	G	V	R	T	E	R	R	D	I	I	K	D	G	I	L	T	Q	W	L	L	T	S	Y	S	A	R	K	L	G	L	K	S	T	G	H	A	G	G	I	H	N	W	R	I	A	G	Q	G	L	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	Q	M	L	K	E	M	G	T	G	L	V	V	T	E	L	M	G	Q	G	V	S	A	I	T	G	D	Y	S	R	G	A	A	G	F	W	V	E	N	G	E	I	Q	Y	P	V	S	E	I	T	I	A	G	N	L	K	D	M	W	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Sequence		N	I	V	T	V	G	N	D	I	E	T	R	S	N	I	Q	C	G	S	V	L	L	P	E	M	K	I	A	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?		?											?	?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand