Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33369 Date Thu Jan 5 11:52:09 GMT 2012 Unique Job ID 748711cc5c4d203b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	R	D	S	F	Y	P	A	I	A	C	F	P	L	L	L	M	L	A	G	C	A	P	M	H	E	T	R	Q	A	L	S	Q	Q	T	P	A	A	Q	V	D	T	A	L	P	T	A	L	K	M	V	G	Q	T	X	Q	W	W	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?															?		?	?	?		?	?		?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	Y	H	D	N	Q	L	T	S	L	I	N	N	A	L	Q	N	A	P	D	M	Q	V	A	E	Q	R	I	Q	L	A	E	A	Q	A	K	A	V	A	T	Q	D	G	P	Q	I	D	F	S	A	D	M	E	R	Q	K	M	S	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	M	G	P	F	A	L	N	D	P	A	A	G	T	T	G	P	W	Y	T	N	G	T	F	G	L	T	A	G	W	H	L	D	I	W	G	K	N	R	A	E	V	T	A	R	L	G	T	V	K	A	R	A	A	E	R	E	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	Q	L	L	A	G	S	V	A	R	L	Y	W	E	W	Q	T	Q	A	A	L	N	T	V	L	Q	Q	I	E	K	E	Q	N	T	I	I	A	T	D	R	Q	L	Y	Q	N	G	I	T	S	S	V	E	G	V	E	T	D	I	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	K	T	R	Q	Q	L	N	D	V	A	G	K	M	K	I	I	E	A	R	L	S	A	L	T	N	N	Q	T	K	S	L	K	L	K	P	V	A	L	P	K	V	A	S	Q	L	P	D	E	L	G	Y	S	L	L	A	R	R	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	Q	A	A	H	W	Y	V	E	S	S	L	S	T	I	D	A	A	K	A	A	F	Y	P	D	I	N	L	M	A	F	L	Q	Q	D	A	L	H	L	S	D	L	F	R	H	S	A	Q	Q	M	G	V	T	A	G	L	T	L	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	D	S	G	R	L	N	A	N	L	D	I	A	K	A	E	S	N	L	S	I	A	S	Y	N	K	A	V	V	E	A	V	N	D	V	A	R	A	A	S	Q	V	Q	T	L	A	E	K	N	Q	H	Q	A	Q	I	E	R	D	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	V	V	G	L	A	Q	A	R	F	N	A	G	I	I	A	G	S	R	V	S	E	A	R	I	P	A	L	R	E	R	A	N	G	L	L	L	Q	G	Q	W	L	D	A	S	I	Q	L	T	G	A	L	G	G	G	Y	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand