Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P46474 Date Thu Jan 5 12:04:13 GMT 2012 Unique Job ID 742fb653648234e4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	R	L	P	G	I	L	L	L	T	G	A	A	L	V	V	I	A	A	L	L	V	S	G	L	R	I	A	L	P	H	L	D	A	W	R	P	E	I	L	N	K	I	E	S	A	T	G	M	P	V	E	A	S	Q	L	S	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	Q	N	F	G	P	T	L	E	A	H	D	I	R	A	E	L	K	D	G	G	E	F	S	V	K	R	V	T	L	A	L	D	V	W	Q	S	L	L	H	M	R	W	Q	F	R	D	L	T	F	W	Q	L	R	F	R	T	N	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?														?		?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	T	S	G	G	S	D	D	S	L	E	A	S	H	I	S	D	L	F	L	R	Q	F	D	H	F	D	L	R	D	S	E	V	S	F	L	T	P	S	G	Q	R	A	E	L	A	I	P	Q	L	T	W	L	N	D	P	R	R	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	E	G	L	V	S	L	S	S	L	T	G	Q	H	G	V	M	Q	V	R	M	D	L	R	D	D	E	G	L	L	S	N	G	R	V	W	L	Q	A	D	D	I	D	L	K	P	W	L	G	K	W	M	Q	D	N	I	A	L	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?												?	?	?				?	?		?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	Q	F	S	L	E	G	W	M	T	I	D	K	G	D	V	T	G	G	D	V	W	L	K	Q	G	G	A	S	W	L	G	E	K	Q	T	H	T	L	S	V	D	N	L	T	A	H	I	T	R	E	N	P	G	W	Q	F	S	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?	?	?	?	?	?	?	?						?							?	?	?	?	?														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	T	R	I	T	M	D	G	K	P	W	P	S	G	A	L	T	L	A	W	I	P	E	Q	D	V	G	G	K	D	N	K	R	S	D	E	L	R	I	R	A	S	N	L	E	L	A	G	L	E	G	I	R	P	L	A	A	K	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?						?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?		?					?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	A	L	G	D	V	W	R	S	T	Q	P	S	G	K	I	N	T	L	A	L	D	I	P	L	Q	A	A	D	K	T	R	F	Q	A	S	W	S	D	L	A	W	K	Q	W	K	L	L	P	G	A	E	H	F	S	G	T	L	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?																						?		?	?								?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	V	E	N	G	L	L	T	A	S	M	K	Q	A	K	M	P	Y	E	T	V	F	R	A	P	L	E	I	A	D	G	Q	A	T	I	S	W	L	N	N	N	K	G	F	Q	L	D	G	R	N	I	D	V	K	A	K	A	V	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	G	G	F	R	Y	L	Q	P	A	N	D	E	P	W	L	G	I	L	A	G	I	S	T	D	D	G	S	Q	A	W	R	Y	F	P	E	N	L	M	G	K	D	L	V	D	Y	L	S	G	A	I	Q	G	G	E	A	D	N	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	V	Y	G	G	N	P	Q	L	F	P	Y	K	H	N	E	G	Q	F	E	V	L	V	P	L	R	N	A	K	F	A	F	Q	P	D	W	P	A	L	T	N	L	D	I	E	L	D	F	I	N	D	G	L	W	M	K	T	D	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	L	G	G	V	R	A	S	N	L	T	A	V	I	P	D	Y	S	K	E	K	L	L	I	D	A	D	I	K	G	P	G	K	A	V	G	P	Y	F	D	E	T	P	L	K	D	S	L	G	A	T	L	Q	E	L	Q	L	D	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?			?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	N	A	R	L	H	L	D	I	P	L	N	G	E	L	V	T	A	K	G	E	V	T	L	R	N	N	S	L	F	I	K	P	L	D	S	T	L	K	N	L	S	G	K	F	S	F	I	N	S	D	L	Q	S	E	P	L	T	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?																?			?															?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		W	F	N	Q	P	L	N	V	D	F	S	T	K	E	G	A	K	A	Y	Q	V	A	V	N	L	N	G	N	W	Q	P	A	K	T	G	V	L	P	E	A	V	N	E	A	L	S	G	S	V	A	W	D	G	K	V	G	I	D	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Y	H	A	G	A	T	Y	N	I	E	L	N	G	D	L	K	N	V	S	S	H	L	P	S	P	L	A	K	P	A	G	E	P	L	A	V	N	V	K	V	D	G	N	L	N	S	F	E	L	T	G	Q	A	G	A	D	N	H	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?																		?			?	?		?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		S	R	W	L	L	G	Q	K	L	T	L	D	R	A	I	W	A	A	D	S	K	T	L	P	P	L	P	E	Q	S	G	V	E	L	N	M	P	P	M	N	G	A	E	W	L	A	L	F	Q	K	G	A	A	E	S	V	G	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		S	F	P	Q	H	I	T	L	R	T	P	M	L	S	L	G	N	Q	Q	W	N	N	L	S	I	V	S	Q	P	T	A	N	G	T	L	V	E	A	Q	G	R	E	I	N	A	T	L	A	M	R	N	N	A	P	W	L	A	N	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?								?	?		?					?																			?		?	?								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		Y	L	Y	Y	N	P	S	V	A	K	T	R	G	D	S	T	P	S	S	P	F	P	T	T	E	R	I	N	F	R	G	W	P	D	A	Q	I	R	C	T	E	C	W	F	W	G	Q	K	F	G	R	I	D	S	D	I	T	I	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		D	T	L	T	L	T	N	G	L	I	D	T	G	F	S	R	L	T	A	D	G	E	W	V	N	N	P	G	N	E	R	T	S	L	K	G	K	L	R	G	Q	K	I	D	A	A	A	E	F	F	G	V	T	T	P	I	R	Q	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		F	N	V	D	Y	D	L	H	W	R	K	A	P	W	Q	P	D	E	A	T	L	N	G	I	I	H	T	Q	L	G	K	G	E	I	T	E	I	N	T	G	H	A	G	Q	L	L	R	L	L	S	V	D	A	L	M	R	K	L	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?		?		?	?		?															?	?	?	?	?			?					?	?	?							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		D	F	R	D	T	F	G	E	G	F	Y	F	D	S	I	R	S	T	A	W	I	K	D	G	V	M	H	T	D	D	T	L	V	D	G	L	E	A	D	I	A	M	K	G	S	V	N	L	V	R	R	D	L	N	M	E	A	V	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?																								?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		P	E	I	S	A	T	V	G	V	A	A	A	F	A	V	N	P	I	V	G	A	A	V	F	A	A	S	K	V	L	G	P	L	W	S	K	V	S	I	L	R	Y	H	I	S	G	P	L	D	D	P	Q	I	N	E	V	L	R	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?		?														?			?	?	?	?		?																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		R	K	E	K	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence