Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AC94 Date Thu Jan 5 11:17:39 GMT 2012 Unique Job ID 739ecc3e080e01c6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	V	L	N	I	L	W	V	V	F	G	I	G	L	M	L	V	L	N	L	K	F	K	I	N	S	M	V	A	L	L	V	A	A	L	S	V	G	M	L	A	G	M	D	L	M	S	L	L	H	T	M	K	A	G	F	G	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	G	E	L	A	I	I	V	V	F	G	A	V	I	G	K	L	M	V	D	S	G	A	A	H	Q	I	A	H	T	L	L	A	R	L	G	L	R	Y	V	Q	L	S	V	I	I	I	G	L	I	F	G	L	A	M	F	Y	E	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	I	M	L	A	P	L	V	I	V	I	A	A	E	A	K	I	P	F	L	K	L	A	I	P	A	V	A	A	A	T	T	A	H	S	L	F	P	P	Q	P	G	P	V	A	L	V	N	A	Y	G	A	D	M	G	M	V	Y	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	V	L	V	T	I	P	S	V	I	C	A	G	L	I	L	P	K	F	L	G	N	L	E	R	P	T	P	S	F	L	K	A	D	Q	P	V	D	M	N	N	L	P	S	F	G	V	S	I	L	V	P	L	I	P	A	I	I	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	T	T	I	A	N	I	W	L	V	K	D	T	P	A	W	E	V	V	N	F	I	G	S	S	P	I	A	M	F	I	A	M	V	V	A	F	V	L	F	G	T	A	R	G	H	D	M	Q	W	V	M	N	A	F	E	S	A	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?		?		?	?	?																												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	I	A	M	V	I	L	I	I	G	A	G	G	V	L	K	Q	T	I	I	D	T	G	I	G	D	T	I	G	M	L	M	S	H	G	N	I	S	P	Y	I	M	A	W	L	I	T	V	L	I	R	L	A	T	G	Q	G	V	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?										?		?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	M	T	A	A	G	I	I	S	A	A	I	L	D	P	A	T	G	Q	L	V	G	V	N	P	A	L	L	V	L	A	T	A	A	G	S	N	T	L	T	H	I	N	D	A	S	F	W	L	F	K	G	Y	F	D	L	S	V	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	L	K	T	W	G	L	L	E	L	V	N	S	V	V	G	L	I	I	V	L	I	I	S	M	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand