Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24211 Date Thu Jan 5 11:41:16 GMT 2012 Unique Job ID 7337bfc9ae0db9b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	R	L	T	T	L	S	H	T	S	E	G	H	R	V	S	V	H	Y	G	Y	D	D	K	G	R	L	T	G	E	R	Q	T	V	E	N	P	E	T	G	E	L	L	W	H	H	E	T	G	H	A	Y	N	E	Q	G	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	R	V	T	P	D	S	L	P	P	V	E	W	L	T	Y	G	S	G	Y	L	A	G	M	K	L	G	G	T	P	L	L	E	F	T	R	D	R	L	H	R	E	T	V	R	S	F	G	S	M	A	G	S	N	A	A	Y	K	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	T	Y	T	P	A	G	Q	L	Q	S	Q	H	L	N	S	L	V	Y	D	R	D	Y	G	W	N	D	N	G	D	L	V	R	I	S	G	P	R	Q	T	R	E	Y	G	Y	S	A	T	G	R	L	E	S	V	R	T	L	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?																				?		?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	D	I	R	I	P	Y	A	T	D	P	A	G	N	R	L	P	D	P	E	L	H	P	D	S	T	L	T	V	W	P	D	N	R	I	A	E	D	A	H	Y	V	Y	R	H	D	E	Y	G	R	L	T	E	K	T	D	R	I	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?		?																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	V	I	R	T	D	D	E	R	T	H	H	Y	H	Y	D	S	Q	H	R	L	V	F	Y	T	R	I	Q	H	G	E	P	L	V	E	S	R	Y	L	Y	D	P	L	G	R	R	M	A	K	R	V	W	R	R	E	R	D	L	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																						?																									?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	M	S	L	S	R	K	P	E	V	T	W	Y	G	W	D	G	D	R	L	T	T	V	Q	T	D	T	T	R	I	Q	T	V	Y	E	P	G	S	F	T	P	L	I	R	V	E	T	E	N	G	E	R	E	K	A	Q	R	R	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	E	T	L	Q	Q	E	G	S	E	N	G	H	G	V	V	F	P	A	E	L	V	R	L	L	D	R	L	E	E	E	I	R	A	D	R	V	S	S	E	S	R	A	W	L	A	Q	C	G	L	T	V	E	Q	L	A	R	Q	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	E	Y	T	P	A	R	K	V	H	F	Y	H	C	D	H	R	G	L	P	L	A	L	I	S	E	D	G	N	T	A	W	R	G	E	Y	D	E	W	G	N	Q	L	N	E	E	N	P	H	H	L	H	Q	P	Y	R	L	P	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																										?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	H	D	E	E	S	G	L	Y	Y	N	R	H	R	H	Y	D	P	L	Q	G	R	Y	I	T	P	D	P	I	G	L	R	G	G	W	N	M	Y	Q	Y	P	L	N	P	I	Q	V	I	D	P	M	G	L	D	A	I	E	N	M	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	G	G	L	I	Y	A	V	S	G	V	P	G	L	I	A	A	N	S	I	T	N	S	A	Y	Q	F	G	Y	D	M	D	A	I	V	G	G	A	H	N	G	A	A	D	A	M	R	H	C	Y	L	M	C	R	M	T	K	T	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?		?		?															?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	T	I	A	D	V	I	G	K	N	H	E	A	A	G	D	R	Q	G	Q	P	A	K	E	R	I	M	D	L	K	N	N	T	V	G	I	A	C	G	D	F	S	A	K	C	S	D	A	C	I	E	K	Y	N	T	G	Q	L	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?				?				?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Sequence		L	D	G	I	K	A	D	N	P	I	K	A	K	Q	G	S	S	D	A	S	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand