Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39381 Date Thu Jan 5 12:00:13 GMT 2012 Unique Job ID 731affe7b0c8820e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	S	S	T	H	P	V	E	R	F	S	F	S	T	A	L	F	G	M	L	V	L	T	L	G	M	G	L	G	R	F	L	Y	T	P	M	L	P	V	M	M	A	E	G	S	F	S	F	S	Q	L	S	W	I	A	S	G	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	G	Y	L	A	G	S	L	L	F	S	F	G	A	F	H	Q	P	S	R	L	R	P	F	L	L	A	S	A	L	A	S	G	L	L	I	L	A	M	A	W	L	P	P	F	I	L	V	L	L	I	R	V	L	A	G	V	A	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	M	L	I	F	G	S	T	L	I	M	Q	H	T	R	H	P	F	V	L	A	A	L	F	S	G	V	G	I	G	I	A	L	G	N	E	Y	V	L	A	G	L	H	F	D	L	S	S	Q	T	L	W	Q	G	A	G	A	L	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	M	L	I	A	L	T	L	L	M	P	S	K	K	H	A	I	T	P	M	P	L	A	K	T	E	Q	Q	I	M	S	W	W	L	L	A	I	L	Y	G	L	A	G	F	G	Y	I	I	V	A	T	Y	L	P	L	M	A	K	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	S	P	L	L	T	A	H	L	W	T	L	V	G	L	S	I	V	P	G	C	F	G	W	L	W	A	A	K	R	W	G	A	L	P	C	L	T	A	N	L	L	V	Q	A	I	C	V	L	L	T	L	A	S	D	S	P	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	I	S	S	L	G	F	G	G	T	F	M	G	T	T	S	L	V	M	T	I	A	R	Q	L	S	V	P	G	N	L	N	L	L	G	F	V	T	L	I	Y	G	I	G	Q	I	L	G	P	A	L	T	S	M	L	S	N	G	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Sequence		A	L	A	S	A	T	L	C	G	A	A	A	L	F	I	A	A	L	I	S	T	V	Q	L	F	K	L	Q	V	V	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand