Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39352 Date Thu Jan 5 11:59:40 GMT 2012 Unique Job ID 72bff5e0b5ad6e6a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	A	W	Y	K	Q	V	N	P	P	Q	R	K	A	L	F	S	A	W	L	G	Y	V	F	D	G	F	D	F	M	M	I	F	Y	I	L	H	I	I	K	A	D	L	G	I	T	D	I	Q	A	T	L	I	G	T	V	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	A	R	P	I	G	G	G	F	F	G	A	M	A	D	K	Y	G	R	K	P	M	M	M	W	A	I	F	I	Y	S	V	G	T	G	L	S	G	I	A	T	N	L	Y	M	L	A	V	C	R	F	I	V	G	L	G	M	S	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	A	C	A	S	T	Y	A	V	E	S	W	P	K	N	L	Q	S	K	A	S	A	F	L	V	S	G	F	S	V	G	N	I	I	A	A	Q	I	I	P	Q	F	A	E	V	Y	G	W	R	N	S	F	F	I	G	L	L	P	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	V	L	W	I	R	K	S	A	P	E	S	Q	E	W	I	E	D	K	Y	K	D	K	S	T	F	L	S	V	F	R	K	P	H	L	S	I	S	M	I	V	F	L	V	C	F	C	L	F	G	A	N	W	P	I	N	G	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	Y	L	A	D	N	G	V	N	T	V	V	I	S	T	L	M	T	I	A	G	L	G	T	L	T	G	T	I	F	F	G	F	V	G	D	K	I	G	V	K	K	A	F	V	V	G	L	I	T	S	F	I	F	L	C	P	L	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	S	V	K	N	S	S	L	I	G	L	C	L	F	G	L	M	F	T	N	L	G	I	A	G	L	V	P	K	F	I	Y	D	Y	F	P	T	K	L	R	G	L	G	T	G	L	I	Y	N	L	G	A	T	G	G	M	A	A	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Sequence		L	A	T	Y	I	S	G	Y	Y	G	L	G	V	S	L	F	I	V	T	V	A	F	S	A	L	L	I	L	L	V	G	F	D	I	P	G	K	I	Y	K	L	S	V	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand