Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45756 Date Thu Jan 5 12:03:32 GMT 2012 Unique Job ID 727a7bd9e889729f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	R	R	E	V	I	L	S	W	L	C	E	K	R	Q	T	W	R	L	C	Y	L	L	G	E	A	G	S	G	K	T	W	L	A	Q	Q	L	Q	K	D	K	H	R	R	V	I	T	L	S	L	V	V	S	W	Q	G	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	W	I	V	T	D	D	N	A	A	E	Q	G	C	R	D	S	A	W	T	R	D	E	M	A	G	Q	L	L	H	A	L	H	R	T	D	S	R	C	P	L	I	I	I	E	N	A	H	L	N	H	R	R	I	L	D	D	L	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	I	S	L	I	P	D	G	Q	F	L	L	I	G	R	P	D	R	K	V	E	R	D	F	K	K	Q	G	I	E	L	V	S	I	G	R	L	T	E	H	E	L	K	A	S	I	L	E	G	Q	N	I	D	Q	P	D	L	L	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?				?	?	?	?	?	?		?	?	?																									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	R	V	L	K	R	I	A	L	L	C	R	G	D	R	R	K	L	A	L	A	G	E	T	I	R	L	L	Q	Q	A	E	Q	T	S	V	F	T	A	K	Q	W	R	M	I	Y	R	I	L	G	D	N	R	P	R	K	M	Q	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	V	M	S	G	T	I	I	A	L	T	C	G	W	L	L	L	S	S	F	T	A	T	L	P	V	P	A	W	L	I	P	V	T	P	V	V	K	Q	D	M	T	K	D	I	A	H	V	V	M	R	D	S	E	A	L	S	V	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	V	W	G	Y	E	V	P	A	D	S	A	W	C	D	Q	A	V	R	A	G	L	A	C	K	S	G	N	A	S	L	Q	T	L	V	D	Q	N	L	P	W	I	A	S	L	K	V	G	D	K	K	L	P	V	V	V	V	R	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?		?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	A	S	V	D	V	L	V	G	Q	Q	T	W	T	L	T	H	K	W	F	E	S	V	W	T	G	D	Y	L	L	L	W	K	M	S	P	E	G	E	S	T	I	T	R	D	S	S	E	E	E	I	L	W	L	E	T	M	L	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	L	H	I	S	T	E	P	S	A	E	W	R	P	L	L	V	E	K	I	K	Q	F	Q	K	S	H	H	L	K	T	D	G	V	V	G	F	S	T	L	V	H	L	W	Q	V	A	G	E	S	A	Y	L	Y	R	D	E	A	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?			?																						?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	P	E	T	T	V	K	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand