Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P09831 Date Wed Jan 25 15:20:14 GMT 2012 Unique Job ID 722e2134c401d045

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	Y	D	K	S	L	E	R	D	N	C	G	F	G	L	I	A	H	I	E	G	E	P	S	H	K	V	V	R	T	A	I	H	A	L	A	R	M	Q	H	R	G	A	I	L	A	D	G	K	T	G	D	G	C	G	L	L	L	Q
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?													?	?	?		?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	P	D	R	F	F	R	I	V	A	Q	E	R	G	W	R	L	A	K	N	Y	A	V	G	M	L	F	L	N	K	D	P	E	L	A	A	A	A	R	R	I	V	E	E	E	L	Q	R	E	T	L	S	I	V	G	W	R	D	V	P
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	N	E	G	V	L	G	E	I	A	L	S	S	L	P	R	I	E	Q	I	F	V	N	A	P	A	G	W	R	P	R	D	M	E	R	R	L	F	I	A	R	R	R	I	E	K	R	L	E	A	D	K	D	F	Y	V	C	S	L	S
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Disorder				?	?			?	?			?																																					?
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Sequence		N	L	V	N	I	Y	K	G	L	C	M	P	T	D	L	P	R	F	Y	L	D	L	A	D	L	R	L	E	S	A	I	C	L	F	H	Q	R	F	S	T	N	T	V	P	R	W	P	L	A	Q	P	F	R	Y	L	A	H	N	G	E
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Disorder																																												?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	N	T	I	T	G	N	R	Q	W	A	R	A	R	T	Y	K	F	Q	T	P	L	I	P	D	L	H	D	A	A	P	F	V	N	E	T	G	S	D	S	S	S	M	D	N	M	L	E	L	L	L	A	G	G	M	D	I	I	R	A
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Sequence		M	R	L	L	V	P	P	A	W	Q	N	N	P	D	M	D	P	E	L	R	A	F	F	D	F	N	S	M	H	M	E	P	W	D	G	P	A	G	I	V	M	S	D	G	R	F	A	A	C	N	L	D	R	N	G	L	R	P	A	R
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	V	I	T	K	D	K	L	I	T	C	A	S	E	V	G	I	W	D	Y	Q	P	D	E	V	V	E	K	G	R	V	G	P	G	E	L	M	V	I	D	T	R	S	G	R	I	L	H	S	A	E	T	D	D	D	L	K	S	R	H
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	Y	K	E	W	M	E	K	N	V	R	R	L	V	P	F	E	D	L	P	D	E	E	V	G	S	R	E	L	D	D	D	T	L	A	S	Y	Q	K	Q	F	N	Y	S	A	E	E	L	D	S	V	I	R	V	L	G	E	N	G	Q
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Disorder		?									?					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	A	V	G	S	M	G	D	D	T	P	F	A	V	L	S	S	Q	P	R	I	I	Y	D	Y	F	R	Q	Q	F	A	Q	V	T	N	P	P	I	D	P	L	R	E	A	H	V	M	S	L	A	T	S	I	G	R	E	M	N	V	F
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		C	E	A	E	G	Q	A	H	R	L	S	F	K	S	P	I	L	L	Y	S	D	F	K	Q	L	T	T	M	K	E	E	H	Y	R	A	D	T	L	D	I	T	F	D	V	T	K	T	T	L	E	A	T	V	K	E	L	C	D	K	A
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Disorder								?	?																																						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	K	M	V	R	S	G	T	V	L	L	V	L	S	D	R	N	I	A	K	D	R	L	P	V	P	A	P	M	A	V	G	A	I	Q	T	R	L	V	D	Q	S	L	R	C	D	A	N	I	I	V	E	T	A	S	A	R	D	P	H
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Disorder																					?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		H	F	A	V	L	L	G	F	G	A	T	A	I	Y	P	Y	L	A	Y	E	T	L	G	R	L	V	D	T	H	A	I	A	K	D	Y	R	T	V	M	L	N	Y	R	N	G	I	N	K	G	L	Y	K	I	M	S	K	M	G	I	S
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	I	A	S	Y	R	C	S	K	L	F	E	A	V	G	L	H	D	D	V	V	G	L	C	F	Q	G	A	V	S	R	I	G	G	A	S	F	E	D	F	Q	Q	D	L	L	N	L	S	K	R	A	W	L	A	R	K	P	I	S	Q
Secondary structure
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Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		G	G	L	L	K	Y	V	H	G	G	E	Y	H	A	Y	N	P	D	V	V	R	T	L	Q	Q	A	V	Q	S	G	E	Y	S	D	Y	Q	E	Y	A	K	L	V	N	E	R	P	A	T	T	L	R	D	L	L	A	I	T	P	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?																	?										?	?		?																?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		N	A	V	N	I	A	D	V	E	P	A	S	E	L	F	K	R	F	D	T	A	A	M	S	I	G	A	L	S	P	E	A	H	E	A	L	A	E	A	M	N	S	I	G	G	N	S	N	S	G	E	G	G	E	D	P	A	R	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?															?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	N	K	V	S	R	I	K	Q	V	A	S	G	R	F	G	V	T	P	A	Y	L	V	N	A	D	V	I	Q	I	K	V	A	Q	G	A	K	P	G	E	G	G	Q	L	P	G	D	K	V	T	P	Y	I	A	K	L	R	Y	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?
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Sequence		P	G	V	T	L	I	S	P	P	P	H	H	D	I	Y	S	I	E	D	L	A	Q	L	I	F	D	L	K	Q	V	N	P	K	A	M	I	S	V	K	L	V	S	E	P	G	V	G	T	I	A	T	G	V	A	K	A	Y	A	D	L
Secondary structure
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Sequence		I	T	I	A	G	Y	D	G	G	T	G	A	S	P	L	S	S	V	K	Y	A	G	C	P	W	E	L	G	L	V	E	T	Q	Q	A	L	V	A	N	G	L	R	H	K	I	R	L	Q	V	D	G	G	L	K	T	G	V	D	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
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Secondary structure
SS confidence
Disorder															?					?	?		?																	?	?	?			?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
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Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?																	?	?
Disorder confidence
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Sequence		C	T	E	N	N	P	P	F	D	N	G	L	L	N	A	Q	L	L	Q	Q	A	K	P	F	V	D	E	R	Q	S	K	T	F	W	F	D	I	R	N	T	D	R	S	V	G	A	S	L	S	G	Y	I	A	Q	T	H	G	D	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?		?	?	?																																																?		?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		L	A	A	D	P	I	K	A	Y	F	N	G	T	A	G	Q	S	F	G	V	W	N	A	G	G	V	E	L	Y	L	T	G	D	A	N	D	Y	V	G	K	G	M	A	G	G	L	I	A	I	R	P	P	V	G	S	A	F	R	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																					?					?
Disorder confidence
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Sequence		E	A	S	I	I	G	N	T	C	L	Y	G	A	T	G	G	R	L	Y	A	A	G	R	A	G	E	R	F	G	V	R	N	S	G	A	I	T	V	V	E	G	I	G	D	N	G	C	E	Y	M	T	G	G	I	V	C	I	L	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		T	G	V	N	F	G	A	G	M	T	G	G	F	A	Y	V	L	D	E	S	G	D	F	R	K	R	V	N	P	E	L	V	E	V	L	S	V	D	A	L	A	I	H	E	E	H	L	R	G	L	I	T	E	H	V	Q	H	T	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		Q	R	G	E	E	I	L	A	N	W	S	T	F	A	T	K	F	A	L	V	K	P	K	S	S	D	V	K	A	L	L	G	H	R	S	R	S	A	A	E	L	R	V	Q	A	Q
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Disorder																																					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
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