Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45546 Date Thu Jan 5 12:03:05 GMT 2012 Unique Job ID 720959e92aeae24e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	L	Y	I	Q	I	I	V	V	A	C	L	T	G	M	T	S	L	L	A	H	R	S	A	A	V	F	H	D	G	I	R	P	I	L	P	Q	L	I	E	G	Y	M	N	R	R	E	A	G	S	I	A	F	G	L	S	I	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	A	S	V	G	I	S	F	T	L	K	T	G	L	L	N	A	W	L	L	F	L	P	T	D	I	L	G	V	L	A	I	N	S	L	M	A	F	G	L	G	A	I	W	G	V	L	I	L	T	C	L	L	P	V	N	Q	L	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	P	V	D	V	L	G	S	L	G	E	L	S	S	P	V	V	S	A	F	A	L	F	P	L	V	A	I	F	Y	Q	F	G	W	K	Q	S	L	I	A	A	V	V	V	L	M	T	R	V	V	V	V	R	Y	F	P	H	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	E	S	I	E	I	F	I	G	M	V	M	L	L	G	I	A	I	T	H	D	L	R	H	R	D	E	N	D	I	D	A	S	G	L	S	V	F	E	E	R	T	S	R	I	I	K	N	L	P	Y	I	A	I	V	G	A	L	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	V	A	S	M	K	I	F	A	G	S	E	V	S	I	F	T	L	E	K	A	Y	S	A	G	V	T	P	E	Q	S	Q	T	L	I	N	Q	A	A	L	A	E	F	M	R	G	L	G	F	V	P	L	I	A	T	T	A	L	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?							?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	V	Y	A	V	A	G	F	T	F	V	Y	A	V	D	Y	L	S	P	N	P	M	V	A	A	V	L	G	A	V	V	I	S	A	E	V	L	L	L	R	S	I	G	K	W	L	G	R	Y	P	S	V	R	N	A	S	D	N	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	A	M	N	M	L	M	E	V	A	L	L	V	G	S	I	F	A	A	I	K	M	A	G	Y	T	G	F	S	I	A	V	A	I	Y	F	L	N	E	S	L	G	R	P	V	Q	K	M	A	A	P	V	V	A	V	M	I	T	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Sequence		L	L	N	V	L	Y	W	L	G	L	F	V	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand