Phyre 2 Results for P04949

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	P04949
Date	Thu Jan 5 10:58:25 GMT 2012
Unique Job ID	71527a9564a91be7

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M A Q V I N T N S L S L I T Q N N I N K N Q S A L S S S I E R L S S G L R I N S A K D D A A G Q A I A N R F T S N I K G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence L T Q A A R N A N D G I S V A Q T T E G A L S E I N N N L Q R V R E L T V Q A T T G T N S E S D L S S I Q D E I K S R L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence D E I D R V S G Q T Q F N G V N V L A K N G S M K I Q V G A N D N Q T I T I D L K Q I D A K T L G L D G F S V K N N D T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ?
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence V T T S A P V T A F G A T T T N N I K L T G I T L S T E A A T D T G G T N P A S I E G V Y T D N G N D Y Y A K I T G G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ?
? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence N D G K Y Y A V T V A N D G T V T M A T G A T A N A T V T D A N T T K A T T I T S G G T P V Q I D N T A G S A T A N L G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ?
? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence A V S L V K L Q D S K G N D T D T Y A L K D T N G N L Y A A D V N E T T G A V S V K T I T Y T D S S G A A S S P T A V K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence L G G D D G K T E V V D I D G K T Y D S A D L N G G N L Q T G L T A G G E A L T A V A N G K T T D P L K A L D D A I A S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence V D K F R S S L G A V Q N R L D S A V T N L N N T T T N L S E A Q S R I Q D A D Y A T E V S N M S K A Q I I Q Q A G N S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . .

Sequence V L A K A N Q V P Q Q V L S L L Q G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand