![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 106 | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | T | V | L | A | G | T | G | S | E | E | G | A | V | T | T | T | T | P | F | G | V | E | L | Q | Q | A | A | D | K | V | T | A | T | I | T | D | K | N | G | A | V | V | R | T | I | D | I | G | E | L | T | A | G | V | H | S | F | T | W | D | G | T | L | T | D | G | S | T | A | P | N | G | S | Y | N | V | A | I | S | A |
| Template Sequence |   | T | I | D | S | P | V | A | G | E | R | F | E | A | G | K | D | I | N | I | S | A | T | V | K | S | K | T | P | V | S | K | V | E | F | Y | . | N | G | D | T | L | I | S | S | D | T | . | . | . | . | . | T | A | P | Y | T | A | K | I | T | . | . | . | . | . | . | . | G | A | A | V | G | A | Y | N | L | K | A | V | A |
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | . | . | . | . | . | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | . | . | . | . | . | . | . | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 3 | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 186 | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | S | N | G | G | T | Q | L | V | A | Q | P | L | Q | F | A | L | V | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | V | L | S | D | G | R | R | I | E | S | P | V | T | P | V | L | V | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||