Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37330 Date Thu Jan 5 11:55:16 GMT 2012 Unique Job ID 70cc66561210888c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	T	I	T	Q	S	R	L	R	I	D	A	N	F	K	R	F	V	D	E	E	V	L	P	G	T	G	L	D	A	A	A	F	W	R	N	F	D	E	I	V	H	D	L	A	P	E	N	R	Q	L	L	A	E	R	D	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	A	A	L	D	E	W	H	R	S	N	P	G	P	V	K	D	K	A	A	Y	K	S	F	L	R	E	L	G	Y	L	V	P	Q	P	E	R	V	T	V	E	T	T	G	I	D	S	E	I	T	S	Q	A	G	P	Q	L	V	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?		?		?	?		?		?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	M	N	A	R	Y	A	L	N	A	A	N	A	R	W	G	S	L	Y	D	A	L	Y	G	S	D	I	I	P	Q	E	G	A	M	V	S	G	Y	D	P	Q	R	G	E	Q	V	I	A	W	V	R	R	F	L	D	E	S	L	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	N	G	S	Y	Q	D	V	V	A	F	K	V	V	D	K	Q	L	R	I	Q	L	K	N	G	K	E	T	T	L	R	T	P	A	Q	F	V	G	Y	R	G	D	A	A	A	P	T	C	I	L	L	K	N	N	G	L	H	I	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	I	D	A	N	G	R	I	G	K	D	D	P	A	H	I	N	D	V	I	V	E	A	A	I	S	T	I	L	D	C	E	D	S	V	A	A	V	D	A	E	D	K	I	L	L	Y	R	N	L	L	G	L	M	Q	G	T	L	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?		?	?		?											?	?	?	?	?		?	?	?		?					?			?	?	?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	M	E	K	N	G	R	Q	I	V	R	K	L	N	D	D	R	H	Y	T	A	A	D	G	S	E	I	S	L	H	G	R	S	L	L	F	I	R	N	V	G	H	L	M	T	I	P	V	I	W	D	S	E	G	N	E	I	P	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?		?			?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	L	D	G	V	M	T	G	A	I	A	L	Y	D	L	K	V	Q	K	N	S	R	T	G	S	V	Y	I	V	K	P	K	M	H	G	P	Q	E	V	A	F	A	N	K	L	F	T	R	I	E	T	M	L	G	M	A	P	N	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	M	G	I	M	D	E	E	R	R	T	S	L	N	L	R	S	C	I	A	Q	A	R	N	R	V	A	F	I	N	T	G	F	L	D	R	T	G	D	E	M	H	S	V	M	E	A	G	P	M	L	R	K	N	Q	M	K	S	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		W	I	K	A	Y	E	R	N	N	V	L	S	G	L	F	C	G	L	R	G	K	A	Q	I	G	K	G	M	W	A	M	P	D	L	M	A	D	M	Y	S	Q	K	G	D	Q	L	R	A	G	A	N	T	A	W	V	P	S	P	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	T	L	H	A	L	H	Y	H	Q	T	N	V	Q	S	V	Q	A	N	I	A	Q	T	E	F	N	A	E	F	E	P	L	L	D	D	L	L	T	I	P	V	A	E	N	A	N	W	S	A	Q	E	I	Q	Q	E	L	D	N	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?		?		?	?	?	?		?									?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	G	I	L	G	Y	V	V	R	W	V	E	Q	G	I	G	C	S	K	V	P	D	I	H	N	V	A	L	M	E	D	R	A	T	L	R	I	S	S	Q	H	I	A	N	W	L	R	H	G	I	L	T	K	E	Q	V	Q	A	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?																												?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	N	M	A	K	V	V	D	Q	Q	N	A	G	D	P	A	Y	R	P	M	A	G	N	F	A	N	S	C	A	F	K	A	A	S	D	L	I	F	L	G	V	K	Q	P	N	G	Y	T	E	P	L	L	H	A	W	R	L	R	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		E	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand